哪些樣本可以做測序呢爽室?樣本RNA如何提取準(zhǔn)備呢?

一淆攻、血液樣本RNA提取準(zhǔn)備


外周血一直被認(rèn)為是容易獲取阔墩,侵害性較小的測序樣本嘿架。且血液樣本處理及保存方法簡便、成本低且富含可利用成分(如血清啸箫、血漿耸彪、白細(xì)胞和紅細(xì)胞等)和生物分子(DNA、RNA筐高、蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物)搜囱。在許多生物樣本庫中,是進(jìn)行多個項目分析的理想實驗材料柑土。然而蜀肘,RNA極易降解,許多因素如內(nèi)源性和外源性的核糖核酸酶(RNase)稽屏。必須注意樣本收集扮宠、穩(wěn)定、保存和運輸狐榔、分離純化操作過程的各個環(huán)節(jié)坛增,從根本上確保獲得高質(zhì)量的血液RNA

血液RNA收集、穩(wěn)定薄腻、保存和運輸收捣、分離純化流程步驟

目前血液RNA提取樣本制備常見的方法有2種,PAXgene RNA tube法?TRIzol法庵楷,接下來會為大家一一詳細(xì)介紹罢艾。

1、PAXgene RNA tube法血液樣本準(zhǔn)備

PAXgene采血管(PAXgene blood RNA tube)經(jīng)常被用于PAXgene法中收集和穩(wěn)定血液RNA尽纽,內(nèi)含能夠穩(wěn)定體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄性狀的抗凝劑咐蚯。目前已有研究表明PAXgene采血管保存全血可以保護(hù)RNA免于降解,具有長期穩(wěn)定性弄贿。

采血后應(yīng)立即將PAXgene采血管輕輕地顛倒8-10次春锋,可確保管內(nèi)保護(hù)劑和血液充分混合均勻。

PAXgene采血管真身就是這個樣子滴

(我們平時去醫(yī)院抽血應(yīng)該都見到過)

2差凹、TRIzol法血液RNA樣本準(zhǔn)備

推薦使用Paxgen Blood RNA tube(全血RNA管)期奔。采血管中添加了保護(hù)試劑,使細(xì)胞內(nèi)的RNA不被降解危尿。在18~25℃可以保存3天能庆,2~8℃可以保存5天,在-20℃或-70℃條件下至少穩(wěn)定50個月脚线,總量≥ 2.5ml,-80°C保存弥搞,干冰運輸邮绿。

3渠旁、血清樣本RNA提取準(zhǔn)備

分離血清血漿應(yīng)嚴(yán)格按照操作說明進(jìn)行,操作需在1h內(nèi)完成船逮,避免出現(xiàn)溶血現(xiàn)象顾腊,血清血漿分離后避免反復(fù)凍融。(推薦抗凝劑:EDTA挖胃、檸檬酸鈉杂靶。)

二、組織樣本RNA提取準(zhǔn)備

1酱鸭、有液氮的條件下

組織樣品在離體后吗垮,快速用Rnase-free配制的生理鹽水或PBS清洗樣本表面污漬,吸干表面液體后迅速將樣本分割成約100mg(綠豆大邪妓琛)烁登,約10小塊左右,將樣本放入已標(biāo)記好名稱且預(yù)冷好的Rnase-free的螺紋管中(不要將蓋子擰死蔚舀,以免從液氮中取出時破裂)饵沧,組織離體后應(yīng)在5min內(nèi)用液氮浸沒,讓其迅速降溫赌躺,徹底冷凍后轉(zhuǎn)移至-80℃狼牺,避免反復(fù)凍融,確保迅速投入液氮中速凍>=1h礼患,然后取出置于-80℃保存是钥,干冰運輸。

2讶泰、無液氮的條件下

提前準(zhǔn)備好RNase-free的1.5mL的EP管咏瑟,向其中加入1mL的RNAlater。組織樣品離體后痪署,快速用RNase-free生理鹽水/PBS清洗樣本表面的污漬码泞,并吸干表面的液體,迅速的將樣本分割后投入提前準(zhǔn)備好的1.5mL的EP管中狼犯,使樣本完全浸沒在液體中余寥,采樣的容器應(yīng)該足夠大,避免組織塊擠在一起悯森,為避免組織塊在運輸?shù)倪^程中露出液面宋舷,應(yīng)將RNAlater灌滿容器,將樣本置于 4°C保存過夜(以使RNAlater完全滲透組織)瓢姻,然后轉(zhuǎn)移至-80°C長期保存祝蝠。

三、體液、糞便樣本RNA提取準(zhǔn)備

收集 5- 10ml 新鮮尿液绎狭、膽汁细溅、糞便或者腹腔引流液;

置于 4°C 或冰盒中正立放置之后轉(zhuǎn)移至 15- 50ml 錐形底的離心管中儡嘶;

4°C 喇聊,1000 rpm ,離心10 min(去除細(xì)胞及碎片)蹦狂;

小心轉(zhuǎn)移上清到新的?15- 50ml 錐形底的離心管中(注意不要轉(zhuǎn)移沉淀)誓篱;

4°C ,2500 rpm 凯楔,離心10 min( 去除殘留的碎片及細(xì)菌細(xì)胞)窜骄;

轉(zhuǎn)移上清至新的 2mlEP 管中,嚴(yán)格封口啼辣,- 80°C長期保存啊研。

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