@單細(xì)胞空間交響樂 所以用Banksy分析更好是嗎辐董？
課后補(bǔ)充----banksy：重塑空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析作者绢片，Evil Genius Building Aggregates with a Neighborhood Kernel and Spatial Yardstick (BA...
IP屬地：密蘇里州
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記錄一些單細(xì)胞測序、空間轉(zhuǎn)錄組的文章陪拘、技術(shù)、處理方法等纤壁，稍顯雜亂左刽。
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R在生物信息分析中有著極其重要的重要悠反，無論我們做什么樣的分析，我們都離不開強(qiáng)大的R馍佑。無論是統(tǒng)計學(xué)分析斋否，還是想得到漂亮的圖形，R都成了我們工作必不可少的一部分拭荤。無論是統(tǒng)計學(xué)算法茵臭，還是測序深度、覆蓋度舅世、熱圖旦委、火山圖、Peak雏亚、PCA缨硝、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、GO罢低、KEGG的圖形化查辩，甚至很多TCGA等數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)的下載，我們無一例外都可以用R實現(xiàn)网持。
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單細(xì)胞測序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析
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收集各種單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析方法
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程戴而！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題瘫絮，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強(qiáng)的專題中了。望見諒填硕！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的麦萤，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq扁眯、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖壮莹、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl姻檀、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用命满，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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對不起 請原諒 謝謝你 我愛你
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請問用這個banksy 和作者其他文章提到的squidpy 有什么區(qū)別慢睡，小白一枚，實驗室剛拿到一批xenium的數(shù)據(jù)铡溪，不知道從何下手
課后補(bǔ)充----banksy：重塑空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析
作者漂辐，Evil Genius Building Aggregates with a Neighborhood Kernel and Spatial Yardstick (BA...
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課后補(bǔ)充----banksy：重塑空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析作者，Evil Genius Building Aggregates with a Neighborhood Kernel and Spatial Yardstick (BA...
