HIFI技術(shù)的簡(jiǎn)介 HiFi reads（High fidelity reads） 是Sequel II 三代測(cè)序平臺(tái)推出的兼顧長(zhǎng)讀長(zhǎng)和高準(zhǔn)確度的測(cè)序序列，一般采用CCS（C...
IP屬地：山西
-
HiFi全基因組測(cè)序技術(shù) -
宏基因組學(xué)/群體遺傳學(xué) 方向
-
使用Agora/ANGEs構(gòu)建祖先核型0.忘了是在那篇文獻(xiàn)看到的，用了Agora，再把Agora的輸出結(jié)果喂給ANGEsAgora和ANGEs都是構(gòu)建祖先核型的軟件個(gè)人實(shí)測(cè)是Agora構(gòu)建的結(jié)果太碎了, ANGE...
-
基因組基因復(fù)制的分類(lèi)鑒定：DupGen-finder
參考：http://www.reibang.com/p/0a14d971bd0a[http://www.reibang.com/p/0a14d971bd0a] requi...
-
完結(jié) | TBtools RNAseq 數(shù)據(jù)分析系列插件注： 沒(méi)想好怎么釋放才對(duì)得起前期支持開(kāi)發(fā)的朋友們。月內(nèi)有空再說(shuō)吧属提。 -- 簡(jiǎn)而言之，本文部分內(nèi)容只適合看看美尸，無(wú)法實(shí)操垒拢。 寫(xiě)在前面 恍恍惚惚旬迹，一個(gè)多月就過(guò)去了。七月底求类，我在公號(hào)...
-
大牛建議：回復(fù)審稿人的十個(gè)步驟
最近有一篇文章在網(wǎng)上廣為流傳，題目叫做：How to Write a Response to Reviewers in Ten Easy Steps【1】屹耐。聽(tīng)起來(lái)是不是有點(diǎn)像...
-
生信技能樹(shù)：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA惶岭，技術(shù)文檔與博客寿弱，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者按灶、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專(zhuān)題症革，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記鸯旁，我們需要你噪矛，將本專(zhuān)題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)铺罢。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集艇挨、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類(lèi)算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
-
從零開(kāi)始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(五)這一部分承接 從零開(kāi)始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(四)韭赘，對(duì)之前的布局進(jìn)行調(diào)整缩滨，使結(jié)構(gòu)更加適合于發(fā)表。 染色體的位置順序 默認(rèn)情況下是會(huì)顯示所有的染色體泉瞻，而且會(huì)先從ath1到ath...
-
Word 學(xué)術(shù)寫(xiě)作標(biāo)準(zhǔn)化排版
Word 學(xué)術(shù)寫(xiě)作標(biāo)準(zhǔn)化排版 一脉漏、 目的是？ 一切自動(dòng)化袖牙，凡是低水平重復(fù)勞動(dòng)侧巨，全部交給電腦自動(dòng)化完成，你只需 操作一次贼陶。 二刃泡、 準(zhǔn)備工作 Office 2007版本以上，20...
-
煙草瞬時(shí)表達(dá)（亞細(xì)胞定位/BiFC）參考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
-
ggplot2繪制-堆疊柱形圖參數(shù)細(xì)講
ggplot2繪制-堆疊柱形圖參數(shù)細(xì)講 昨天我們主要說(shuō)了如何使用群落微生物的物種屬水平豐度表來(lái)繪制堆疊柱形圖。但是昨天沒(méi)有對(duì)ggplot2來(lái)繪制堆疊柱形圖的具體參數(shù)來(lái)說(shuō)明撮胧，那...
-
用python從gbff文件中直接提取cds序列
首先铺峭，我們要了解一下什么是GBFF文件 GenBank純文本文件格式(GenBank flatfile， 簡(jiǎn)稱(chēng)GBFF) GBFF是GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)的基本信息單位 GBF...
-
如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(下)
在上一篇教程的最后汽纠，我寫(xiě)道「我們能夠更加直觀的觀察到2個(gè)peak卫键，基本確定2個(gè)多倍化事件」。這里就引出了一個(gè)問(wèn)題虱朵，為什么我們可以根據(jù)peak來(lái)推斷多倍化時(shí)間莉炉？在Lynch和C...
-
如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進(jìn)化的重要?jiǎng)恿ΑＨ绻粋€(gè)物種在演化過(guò)程中發(fā)生過(guò)多倍化碴犬，那么在基因組上就會(huì)存在一些共線性區(qū)域（即兩個(gè)區(qū)域之間的...
-
如何學(xué)習(xí)生信什么是bioinformatician 如何你想成為一名生信人絮宁，那么至少你需要了解什么叫做生物信息學(xué)。否者服协，朝著錯(cuò)誤的方向再努力也是白費(fèi)勁绍昂。 什么是生物信息學(xué)呢？在陳銘主編的...
-
實(shí)驗(yàn)技術(shù)（1）——載體構(gòu)建相關(guān)常規(guī)載體構(gòu)建原理及流程較為簡(jiǎn)單偿荷，具體操作也比較容易窘游。這里進(jìn)行簡(jiǎn)單總結(jié)，并對(duì)幾點(diǎn)需要注意的點(diǎn)進(jìn)行說(shuō)明遭顶。 原理依賴(lài)于限制性核酸內(nèi)切酶张峰，DNA連接酶和其他修飾酶的作用，分別對(duì)目的基...
-
使用EGGNOG-Mapper對(duì)非模式物種快速進(jìn)行GO或KEGG注釋對(duì)于非模式物種棒旗，需要做GO或KEGG富集喘批，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來(lái)對(duì)你的物種序列進(jìn)行快速注釋。在注釋結(jié)果文件中铣揉，可以同時(shí)獲得序列映射上的GO號(hào)或KO號(hào)饶深，直接提...
-
我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開(kāi)始自學(xué)生物信息逛拱，那個(gè)時(shí)候敌厘，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記朽合。 我有一個(gè)自己的博客俱两，xu...
