HIFI技術的簡介 HiFi reads（High fidelity reads） 是Sequel II 三代測序平臺推出的兼顧長讀長和高準確度的測序序列掩缓，一般采用CCS（C...
IP屬地：重慶
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HiFi全基因組測序技術 -
宏基因組學/群體遺傳學 方向
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使用Agora/ANGEs構建祖先核型0.忘了是在那篇文獻看到的捏肢，用了Agora，再把Agora的輸出結果喂給ANGEsAgora和ANGEs都是構建祖先核型的軟件個人實測是Agora構建的結果太碎了, ANGE...
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基因組基因復制的分類鑒定：DupGen-finder
參考：http://www.reibang.com/p/0a14d971bd0a[http://www.reibang.com/p/0a14d971bd0a] requi...
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完結 | TBtools RNAseq 數(shù)據(jù)分析系列插件注： 沒想好怎么釋放才對得起前期支持開發(fā)的朋友們。月內有空再說吧。 -- 簡而言之肯骇，本文部分內容只適合看看，無法實操祖很。 寫在前面 恍恍惚惚笛丙，一個多月就過去了。七月底假颇，我在公號...
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大牛建議：回復審稿人的十個步驟
最近有一篇文章在網上廣為流傳胚鸯，題目叫做：How to Write a Response to Reviewers in Ten Easy Steps【1】。聽起來是不是有點像...
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生信技能樹：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術文檔與博客镜豹，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡書創(chuàng)作和做筆記的生信學習者蓝牲、愛好者以及相關編程人員加入本專題趟脂，貢獻你的文字，無論是原創(chuàng)還是筆記例衍，我們需要你昔期，將本專題打造為生信知識寶庫、交流平臺佛玄。 內容可以是對生物信息學與算法知識相關資源的收集硼一、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計 * 計算生物學 * 各類算法 * 機器學習
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從零開始學CIRCOS繪制圈圖(五)這一部分承接 從零開始學CIRCOS繪制圈圖(四)梦抢，對之前的布局進行調整般贼，使結構更加適合于發(fā)表。 染色體的位置順序 默認情況下是會顯示所有的染色體奥吩，而且會先從ath1到ath...
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Word 學術寫作標準化排版
Word 學術寫作標準化排版 一哼蛆、 目的是？ 一切自動化霞赫，凡是低水平重復勞動腮介，全部交給電腦自動化完成，你只需 操作一次端衰。 二叠洗、 準備工作 Office 2007版本以上甘改，20...
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煙草瞬時表達（亞細胞定位/BiFC）參考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
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ggplot2繪制-堆疊柱形圖參數(shù)細講
ggplot2繪制-堆疊柱形圖參數(shù)細講 昨天我們主要說了如何使用群落微生物的物種屬水平豐度表來繪制堆疊柱形圖十艾。但是昨天沒有對ggplot2來繪制堆疊柱形圖的具體參數(shù)來說明，那...
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用python從gbff文件中直接提取cds序列
首先榄融，我們要了解一下什么是GBFF文件 GenBank純文本文件格式(GenBank flatfile， 簡稱GBFF) GBFF是GenBank數(shù)據(jù)庫的基本信息單位 GBF...
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如何用WGDI進行共線性分析(下)
在上一篇教程的最后救湖，我寫道「我們能夠更加直觀的觀察到2個peak愧杯，基本確定2個多倍化事件」。這里就引出了一個問題鞋既，為什么我們可以根據(jù)peak來推斷多倍化時間力九？在Lynch和C...
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如何用WGDI進行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進化的重要動力。如果一個物種在演化過程中發(fā)生過多倍化邑闺，那么在基因組上就會存在一些共線性區(qū)域（即兩個區(qū)域之間的...
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實驗技術（1）——載體構建相關常規(guī)載體構建原理及流程較為簡單靶衍，具體操作也比較容易灾炭。這里進行簡單總結，并對幾點需要注意的點進行說明颅眶。 原理依賴于限制性核酸內切酶蜈出，DNA連接酶和其他修飾酶的作用，分別對目的基...
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使用EGGNOG-Mapper對非模式物種快速進行GO或KEGG注釋對于非模式物種涛酗，需要做GO或KEGG富集铡原，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對你的物種序列進行快速注釋。在注釋結果文件中商叹，可以同時獲得序列映射上的GO號或KO號眷蜈，直接提...
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我的生信自學心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學生物信息沈自，那個時候酌儒，為了加深自己學習，所以就不間斷的在網上分享我的學習筆記枯途。 我有一個自己的博客忌怎，xu...
