IP屬地：陜西
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從0開始镜廉，包括軟件安裝奠宜，環(huán)境設(shè)置跑杭，原始數(shù)據(jù)下載辙芍，轉(zhuǎn)換啡彬，差異基因分析等整個流程
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時間才把GWAS整個流程捋完，從背景到code沸手、還有過程中遇到的一些bug以及解決辦法外遇，加起來也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單契吉，也許以后有新的方法或者...
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DAP-seq--研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控新方法跳仿，不受物種限制、高通量捐晶、無需抗體菲语，研究蛋白與DNA互作的新方法（體外ChIP-seq）一、 DAP-seq技術(shù)簡介 DAP-seq（DNA親和純化測序）技術(shù)服務(wù)——高通量檢測轉(zhuǎn)錄因子或DNA結(jié)合蛋白在基因組上的結(jié)合位點惑灵。 在功能基因組學和表觀遺傳學研究中山上，轉(zhuǎn)錄...
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2022-11-28第五章回歸分析使用lm()函數(shù)建立多元線性回歸模型佩憾，使用glm()建立廣義線性回歸模型。 廣義線性模型之泊松回歸[https://blog.csdn.net/qq_44638724/art...
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使用TBtools進行本地blast并根據(jù)blast結(jié)果提取相關(guān)序列TBtools 是一個集合了超多生信處理的小工具鬼廓，非常方便，而且是無命令行的操作致盟，入門門檻極低碎税。開發(fā)者是華南農(nóng)業(yè)大學陳程杰博士，TBtools文章地址：https://www...
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教你畫一個掰彎的熱圖（Heatmap）馏锡，展示更多的基因表達量難道雷蹂，這不像孔雀開屏嗎？ 寫在前面 組學數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫眷篇，但是信息的挖掘仍任重道遠萎河。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時間蕉饼，或者將看起來很復雜，很難以完成的事情玛歌，變得非常簡單昧港。...
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R數(shù)據(jù)可視化5:熱圖Heatmap最近休息了幾天。沒有來得及更新支子。今天我們來講一講熱圖怎么繪制 什么是熱圖(Heatmap) 熱圖是一個以顏色變化來顯示數(shù)據(jù)的矩陣创肥。Toussaint Loua在1873年就曾...
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相關(guān)性熱圖的繪制及意義關(guān)于相關(guān)性，表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系值朋。但需要注意叹侄，數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系。 相關(guān)性在組學數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣昨登，如樣本的重復檢驗趾代、基因的共表達分析、微生物群落...
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相關(guān)性熱圖
關(guān)于相關(guān)性丰辣，表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系撒强。但需要注意，數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系笙什。 相關(guān)性在組學數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣飘哨，如樣本的重復檢驗、基因的共表達分析琐凭、微生物群落...
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20個轉(zhuǎn)錄組知識點-你必須知道芽隆！
隨著測序成本的不斷下降，轉(zhuǎn)錄組測序分析已然成為生物學及醫(yī)學研究不可或缺的技術(shù)手段。 但是胚吁，對于大多數(shù)初學者來說臼闻，會遇到各種各樣的問題。這里囤采，小編就給大家重點介紹一下轉(zhuǎn)錄組測序...
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轉(zhuǎn)錄組分析入門 2 —— 基本流程?? 注：此文基本全部按照 簡書 劉小澤：轉(zhuǎn)錄組那些事兒 Part II 進行乓搬，感謝??，以下代碼親測有效代虾，如有問題歡迎隨時與我溝通进肯。 準備工作?? 1. 登錄服務(wù)器（本小白...
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轉(zhuǎn)錄組介紹
轉(zhuǎn)錄組（transcriptome),額定類型細胞中全體轉(zhuǎn)錄本（transcript）的集合，是細胞特定時刻基因表達譜的一個快照（snapshot of expression...
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轉(zhuǎn)錄組分析流程概念及類型： 轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下棉磨，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合江掩，包括信使RNA、核糖體RNA乘瓤、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA环形；狹義上指所有mRN...
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后續(xù)在哪里看
酵母雙雜交系統(tǒng)解析
1. 簡介 研究蛋白質(zhì)之間的相互作用是當前蛋白質(zhì)組學研究中的一個熱點统抬，常見的研究方法有以下多種： 其中酵母雙雜交技術(shù)作為發(fā)現(xiàn)和研究在活細胞體內(nèi)的蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用的...
