拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完研铆,從背景到code埋同、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法,加起來(lái)也有二十余篇棵红,按分析的流程整理出一份清單凶赁,也許以后有新的方法或者...
一交煞、 DAP-seq技術(shù)簡(jiǎn)介 DAP-seq(DNA親和純化測(cè)序)技術(shù)服務(wù)——高通量檢測(cè)轉(zhuǎn)錄因子或DNA結(jié)合蛋白在基因組上的結(jié)合位點(diǎn)咏窿。 在功能基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究中,轉(zhuǎn)錄...
使用lm()函數(shù)建立多元線性回歸模型,使用glm()建立廣義線性回歸模型稚茅。 廣義線性模型之泊松回歸[https://blog.csdn.net/qq_44638724/art...
TBtools 是一個(gè)集合了超多生信處理的小工具欺税,非常方便侈沪,而且是無(wú)命令行的操作,入門(mén)門(mén)檻極低晚凿。開(kāi)發(fā)者是華南農(nóng)業(yè)大學(xué)陳程杰博士亭罪,TBtools文章地址:https://www...
難道歼秽,這不像孔雀開(kāi)屏嗎应役? 寫(xiě)在前面 組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫,但是信息的挖掘仍任重道遠(yuǎn)燥筷。順手的工具箩祥,可以節(jié)省使用者盡可能多的時(shí)間,或者將看起來(lái)很復(fù)雜肆氓,很難以完成的事情袍祖,變得非常簡(jiǎn)單。...
最近休息了幾天谢揪。沒(méi)有來(lái)得及更新蕉陋。今天我們來(lái)講一講熱圖怎么繪制 什么是熱圖(Heatmap) 熱圖是一個(gè)以顏色變化來(lái)顯示數(shù)據(jù)的矩陣捐凭。Toussaint Loua在1873年就曾...
關(guān)于相關(guān)性,表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系寺滚。但需要注意柑营,數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系。 相關(guān)性在組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣村视,如樣本的重復(fù)檢驗(yàn)、基因的共表達(dá)分析酒奶、微生物群落...
關(guān)于相關(guān)性蚁孔,表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系。但需要注意惋嚎,數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系杠氢。 相關(guān)性在組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣,如樣本的重復(fù)檢驗(yàn)另伍、基因的共表達(dá)分析鼻百、微生物群落...
隨著測(cè)序成本的不斷下降摆尝,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析已然成為生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究不可或缺的技術(shù)手段温艇。 但是,對(duì)于大多數(shù)初學(xué)者來(lái)說(shuō)堕汞,會(huì)遇到各種各樣的問(wèn)題勺爱。這里,小編就給大家重點(diǎn)介紹一下轉(zhuǎn)錄組測(cè)序...
?? 注:此文基本全部按照 簡(jiǎn)書(shū) 劉小澤:轉(zhuǎn)錄組那些事兒 Part II 進(jìn)行人灼,感謝??围段,以下代碼親測(cè)有效,如有問(wèn)題歡迎隨時(shí)與我溝通投放。 準(zhǔn)備工作?? 1. 登錄服務(wù)器(本小白...
轉(zhuǎn)錄組(transcriptome),額定類(lèi)型細(xì)胞中全體轉(zhuǎn)錄本(transcript)的集合奈泪,是細(xì)胞特定時(shí)刻基因表達(dá)譜的一個(gè)快照(snapshot of expression...
概念及類(lèi)型: 轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合跪呈,包括信使RNA段磨、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA耗绿;狹義上指所有mRN...
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酵母雙雜交系統(tǒng)解析1. 簡(jiǎn)介 研究蛋白質(zhì)之間的相互作用是當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的一個(gè)熱點(diǎn)晴埂,常見(jiàn)的研究方法有以下多種: 其中酵母雙雜交技術(shù)作為發(fā)現(xiàn)和研究在活細(xì)胞體內(nèi)的蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用的...