中農(nóng)在讀博士莱没，歡迎關(guān)注個人公號【BioparaMeta】一起學(xué)習(xí)米辐、交流
發(fā)簡信
IP屬地：天津
-
這個世界流行離開便贵，但我們卻不擅長告別
-
-
零基礎(chǔ)學(xué)生信入門筆記(R語言肠骆、Linux算途、Python、RNA-seq蚀腿、單細(xì)胞測序嘴瓤、質(zhì)譜流式、TCGA唯咬、GEO纱注、單細(xì)胞經(jīng)典文獻(xiàn)解讀)
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語言[https://www...
-
秘籍 | 驚了胆胰，使用aspera下載SRA數(shù)據(jù)速度高達(dá) 291Mb/s
2024年5月20日更新：目前大家可以參考這篇??狞贱，更加方便：生信 | 超便捷！iSeq同時支持快速下載GSA/SRA/ENA的數(shù)據(jù)[https://www.jianshu.c...
-
WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號為KPGP-00001的數(shù)據(jù)蜀涨。 先說一下KPGP吧瞎嬉，中文名叫韓國個人基因組計(jì)...
-
腫瘤外顯子全流程notesPart0背景知識 Q：什么是外顯子測序呢？A：外顯子組測序是指利用序列捕獲或者靶向技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA富集后再進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法厚柳。外顯子組包含約1%的...
-
-
基因ID轉(zhuǎn)換方法總結(jié)1. clusterProfiler包，bitr()轉(zhuǎn)換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫的一個功能強(qiáng)大的R包，可以用來做各種富集分析烧董，如GO毁靶、KEGG、DO...
-
-
生信技能樹周末班全套練習(xí)題
-
跟著生信技能樹花花老師學(xué)了幾天的TCGA系列課程扇商，這里就整理下凤瘦，發(fā)現(xiàn)了當(dāng)時學(xué)的時候沒有注意的知識點(diǎn)。加油~
-
-
wilcox.test 進(jìn)行 RNAseq 差異表達(dá)基因分析
如果拿到的表達(dá)譜不是原始的read counts數(shù)據(jù)而是TPM值，就不能用包（比如DESeq2）來進(jìn)行差異表達(dá)基因分析红且。我們可以手動用wilcox.test 函數(shù)手動進(jìn)行分析...
-
公眾號：誤入BioInfor的大黃鴨
-
TCGA+biomarker——單因素Cox回歸
生存分析KM法與Cox法異同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一種無參數(shù)方法(non-parametric)來從觀察的生存時間來估計(jì)...
-
TCGA生存模型的構(gòu)建以及模型預(yù)測和評估生存模型的構(gòu)建方法包括：1. Lasso回歸思喊；2. Cox多因素回歸壁酬；3. 隨機(jī)森林；4. 支持向量機(jī) 可以把log_rank_test或cox篩選出的基因單獨(dú)做模型構(gòu)建恨课，也...
