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今天給小朋友數(shù)據(jù)可視化工具時候，發(fā)現(xiàn)國內(nèi)很多人開發(fā)出來數(shù)據(jù)可視化平臺场梆，可以滿足許多數(shù)據(jù)可視化需要日月。想著干脆整了一個目錄貼。簡單記錄下來宛瞄，幾個我不時會看到的浮禾，都是非常漂亮的工作...

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文不如表，表不如圖裸影。 Excel很大的一個優(yōu)勢是挣轨，能夠很方便地制作各種數(shù)據(jù)圖。但轩猩，有時我們制作的柱狀圖卷扮，會出現(xiàn)這樣的情況： 例：和馬云、王思聰對比年收入(本文數(shù)據(jù)純屬虛構(gòu),不...

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人基因組長度約為30億堿基對均践，即：3*109 bp晤锹； DNA每bp平均分子量為：660 g/mol； 長度為L bp的DNA分子的分子量M為：L*660 g/mol彤委； -1....

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尚未進行基因組測序的物種鞭铆，在進行基因組測序前，首先需對該物種進行 genome survey。一般通過兩個途徑：細胞遺傳學(xué)（這里只講流式細胞術(shù)）和基因組測序 1车遂、基因組大小定...

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MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)— 分子演化遺傳分析 MEGA是一款操作簡單的系統(tǒng)發(fā)育分析軟件封断。 NJ法構(gòu)建的樹...

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如何用MEGA-X構(gòu)建進化樹_生物研究_實用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...

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An enormous Paris polyphylla genome sheds light on genome size evolution and polyphylli...

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這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時的筆記柄瑰。目前來看，背景介紹和軟件使用說明都基本沒啥問題剪况。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進行比較基因組學(xué)中相關(guān)分析教沾，教程見如何用WG...

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作者：May審稿：童蒙編輯：amethyst 01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, ...

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BUSCO是Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs（通用單拷貝同源基因基準(zhǔn)）的縮寫，基于基因進化（有參比對）評估基因組組裝和...

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教程來源https://www.omicsclass.com/article/675 FigTree可以基于系統(tǒng)進化樹分析文件nwk進行進化樹顯示和美化译断，具體可以參考：htt...

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讀文獻時详囤，有時求相關(guān)系數(shù)，有時求擬合優(yōu)度镐作，到底都是什么呢藏姐？ 先給結(jié)論，R與R^2沒有關(guān)系该贾，就如同標(biāo)準(zhǔn)差與標(biāo)準(zhǔn)誤差沒有關(guān)系一樣羔杨。 1. 相關(guān)系數(shù)（R） 定義：變量之間線性相關(guān)的...

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推斷物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系以及分歧時間對探討物種起源與演化具有重要意義。通過最大似然法（ML）構(gòu)建物種進化樹以及估算物種分化時間在比較基因組學(xué)的研究進展中已經(jīng)成為了必不可少的“套路...

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差異代謝物分析 差異代謝物分析包括多元統(tǒng)計分析和單維統(tǒng)計分析杨蛋，其中多元統(tǒng)計能捕捉到具有相互關(guān)聯(lián)的差異性變量有利于代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究兜材；單維的統(tǒng)計能獨立分析單個變量的統(tǒng)計學(xué)意義，在...

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二代數(shù)據(jù)組裝 構(gòu)建contig：將所有小片段打成K-mer構(gòu)建de Bruijn圖逞力，然后會根據(jù)給定的參數(shù)對de Bruijn圖做一些化簡曙寡，最后連接K-mer的路徑即可得到co...

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選擇最優(yōu)樹——NP-complete問題 （以下內(nèi)容都是基于Christopher P. Randle教授在研究組上交流時的課件整理而來。感謝Christopher寇荧。） 在介...