發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
-
R語言處理基因芯片測序得到的SNP數(shù)據(jù)的一個簡單小例子~進化樹和PCA最終拿到的數(shù)據(jù)格式如下 第一列是探針id 第二列是染色體編號 第三類是染色體位置 第四列是第一個樣本的基因型 接下來依次是每個樣本的基因型 相當于是每行是一個位點挪蹭，每列是一個...
-
-
【非模式種轉(zhuǎn)錄組】二惶凝、下游分析R語言篇這里是佳奧笋额！我們繼續(xù)非模式種轉(zhuǎn)錄組的下游分析岸梨。 上篇我們拿到了raw count矩陣喜颁，但是我們還缺少很多東西稠氮，讓我們一步一步來。 1半开、選擇合適方法標準化表達矩陣 2隔披、GO/K...
-
可關(guān)注微信公眾號：醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)<br>（筆記在公眾號上更新）
-
已畢業(yè)纠永，抱歉不搞這個了
-
4個PG基因組SSRs數(shù)量分布一鬓长、統(tǒng)計tns不同染色體上SSR分布 重命名序列名，使用sed命令(1)先修改染色體序列名稱 （2）重新查看序列名稱 尝江，因為使用less -SN后一行內(nèi)容太多不能全部復(fù)制 （...
-
SSR (misa + primer3 ) 設(shè)計SSR引物
先下載 primer3 和 misa 相關(guān)文件 misa 相關(guān)文件放在百度云鏈接：https://pan.baidu.com/s/1C4eU30yyLr7iNGiuGEmPt...
-
-
-
-
跟著Nature Genetics學(xué)畫圖：R語言ggplot2畫圖展示SNP位點的堿基類型論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
-
-
群體遺傳學(xué)親緣關(guān)系分析親緣關(guān)系分析實操 前期準備 給標記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)彼妻，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個SNP位點的ID嫌佑。先看一下最開始生成的VCF文...
-
-
研究方向：基因組學(xué)幽邓、轉(zhuǎn)錄組學(xué)炮温、遺傳學(xué)<br>邊做邊分享，超不定期更新
-
-
-
復(fù)現(xiàn)Nature genetic圖表：ggplot繪制點線圖
近期在看一篇Nature genetics關(guān)于自閉癥的研究文章的時候担巩，看到了這樣的可視化圖表，是一種點線圖没炒。 文章提供了數(shù)據(jù)涛癌，一開始我想到的繪制方法是畫出線圖，線的上下就是數(shù)...
-
一些常用小腳本記錄
記錄下小編自己可能用到的小腳本 （1）fasta轉(zhuǎn)phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.phy （2）fastq轉(zhuǎn)fast...
