公眾號(hào) 生信小課堂
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GEO2R的limma差異分析流程【芯片microarray數(shù)據(jù)】附limma+RNAseq參考學(xué)習(xí)GEO提供的GEO2R在線差異分析工具使用的代碼流程黄鳍。筆記里的代碼在理解每一步的基礎(chǔ)上，部分做了修改钥顽。但大致思路不變块仆，即使用limma包對(duì)芯片測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析(暫...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
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擬時(shí)序分析的熱圖提取基因問(wèn)題昨天我在單細(xì)胞天地講解了使用monocle2進(jìn)行擬時(shí)序分析的方法犁河，基本上跟著我的代碼走一波就可以學(xué)會(huì)了，當(dāng)然具體參數(shù)理解需要自行發(fā)力哦魄梯，見(jiàn)：使用monocle做擬時(shí)序分析（單...
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R自定義啟動(dòng)環(huán)境（.Rprofile)1. 三個(gè)目錄 R_HOME桨螺、HOME、working directory酿秸。 R_HOME: the directory in which R is installed. F...
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周運(yùn)來(lái)煌张，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥糊治，穩(wěn)健唱矛，瀟灑，大方井辜，靠譜。一段生信緣管闷，一棵技能樹(shù)粥脚。生信技能樹(shù)核心成員，單細(xì)胞天地供稿人包个，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者刷允，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家冤留。
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單細(xì)胞與GWAS數(shù)據(jù)的聯(lián)合分析復(fù)雜性狀的細(xì)胞類型表達(dá)特異性整合（CELLECT）是一個(gè)計(jì)算工具包，用于識(shí)別復(fù)雜性狀潛在的可能病因細(xì)胞類型树灶。CELLECT利用現(xiàn)有的遺傳優(yōu)先級(jí)模型纤怒，在識(shí)別可能的病因細(xì)胞類型時(shí)...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書(shū)鎖了
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公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組诺祸、腫瘤免疫携悯、單細(xì)胞組學(xué)
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seurat單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組整合分析教程-01前段時(shí)間跟師兄聊天，聊到seurat包筷笨，他說(shuō)學(xué)軟件一定要知道這個(gè)軟件開(kāi)發(fā)的目的憔鬼，它是要解決哪些主要問(wèn)題，哪些是次要問(wèn)題胃夏，次要問(wèn)題其他R包同樣解決轴或，他開(kāi)發(fā)的主線是什么。單細(xì)胞多...
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歡迎關(guān)注微信公眾號(hào)<生信修煉手冊(cè)><br>關(guān)注公眾號(hào)囊榜，可以加入微信群，一起交流溝通
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2019.8月中旬開(kāi)始系統(tǒng)自學(xué)生信，<br>自學(xué)路漫漫索性報(bào)個(gè)班烫扼。<br><br>生信技能樹(shù)真的很棒曙求！<br><br>這是我的一個(gè)學(xué)習(xí)筆記平臺(tái)，點(diǎn)滴記錄映企。
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心堰氓，又辜負(fù)了努力
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