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表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（eQTL）的概念及其相關(guān)分析
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（expression quantitative trait locus, eQTL）是一類能夠影響基因表達(dá)量的遺傳位點(diǎn)（大部分都是單核苷酸多態(tài)性测摔，SNP）慨仿，...
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單細(xì)胞: 將meta.data plot 到UMAP圖上的幾種方法這里準(zhǔn)備了一個(gè)文件防楷，是要將這個(gè)文件中的信息plot到umap圖上，文件有3列 今天的目標(biāo)就是: 將第一列barcode plot到umap上 將第二列clonotype id...
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圖表復(fù)現(xiàn)-加強(qiáng)調(diào)色的泛癌免疫浸潤箱線圖文章： Adrenocortical Carcinoma Steroid Profiles: In Silico Pan-Cancer Analysis of TCGA Da...
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重測(cè)序分析（18）GWAS分析實(shí)操（4）gwas_tassel_mlm混合線性模型MLM：GLM模型中则涯，如果兩個(gè)表型差異很大复局，但群體本身還含有其他的遺傳差異（如地域等），則那些與該表型無關(guān)的遺傳差異也會(huì)影響到相關(guān)性粟判。MLM模型可以把群體結(jié)構(gòu)的影...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心档礁，又辜負(fù)了努力
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努力學(xué)代碼的超級(jí)無敵大蝸牛??
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重測(cè)序分析（16）GWAS分析實(shí)操（2）gwas_emmax_Q使用Q矩陣作為協(xié)變量使用emmax進(jìn)行GWAS分析 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 1.上個(gè)推文中vcf轉(zhuǎn)的tped文件snp_filter.mapsnp_filter.nosexsnp_filt...
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R語言利用轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)矩陣做基因共表達(dá)分析的學(xué)習(xí)資料推薦參考資料鏈接 https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tree/v1.0.1[https://github.com/cx...
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NCBI公共數(shù)據(jù)庫下載10x單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析的全流程參考生信技能書一文打通單細(xì)胞上游：從軟件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqjN4lLA]prefetch官...
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