這是一個新系列 差不多是一年以前，我定導(dǎo)后沒多久痴奏，接手了讀研后的第一個課題笨奠。合作方是醫(yī)院，和我對接的是一名博一的醫(yī)學(xué)生残邀，最開始兩邊的老師很排斥常規(guī)的單細(xì)胞文章思路值骇，即各大類細(xì)...
IP屬地：湖北
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單細(xì)胞分析實錄(1): 認(rèn)識Cell Hashing -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞類型注釋分析合集
SingleR 使用SingleR包進(jìn)行單細(xì)胞類型注釋分析 Celaref 使用Celaref包進(jìn)行單細(xì)胞類型注釋分析（一）：Celaref Overview and Ins...
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scCustomize：自定義可視化你的單細(xì)胞數(shù)據(jù)（一）
簡介 scCustomize是一個單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化的R包，里面集合了一些常用的數(shù)據(jù)可視化方法摘刑，可以與Seurat包進(jìn)行很好的聯(lián)用进宝，支持Seurat，LIGER和SCE等...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)008--[sc]兩篇PBMC單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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泛癌的免疫浸潤可視化好久不見胡控！我的產(chǎn)假還剩一個多月扳剿，小娃娃兩個半月了，天使寶寶昼激，省爹省媽庇绽，所以我也有些時間了锡搜，陸續(xù)開始學(xué)習(xí)和備課，整理資料咯瞧掺。 從Timer2.0的主頁發(fā)現(xiàn)了一個優(yōu)秀的資源： h...
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R語言4.3該考慮更新了耕餐，或者也可以…初學(xué)者 推薦直接裝最新版R。見https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/[https://www.bilibili.com/vi...
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可以用options(timeout=10000)
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問題 在安裝包時warning顯示該包基于R 4.3.2建立，warning太多看著煩于是想要進(jìn)行更新看網(wǎng)上教程可用installr包的updateR函數(shù) 直接打開R（不是R...
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芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了释簿，前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳亚隅，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白庶溶，也剛剛了解NG...
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R語言中的管道%>%
本文首發(fā)于我的個人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] ％>％來自dplyr包的管道函數(shù)煮纵，我們可以將其理解為車間里的流水線，經(jīng)過前一步加工...
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TCGA / 癌癥簡稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對照
TCGA數(shù)據(jù)庫中含有的癌癥名稱偏螺，簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
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單細(xì)胞之富集分析-6：PROGENy單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：單細(xì)胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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Seurat官方教程 | pbmc3k_tutorial最新版Compiled: March 18, 2021 來源：https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html[...
