前言： AlphaFold2在CASP14蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)關(guān)鍵評(píng)估大賽中奪得第一名的好成績(jī)吝镣，其預(yù)測(cè)的大部分結(jié)構(gòu)達(dá)到了空前的準(zhǔn)確度，與實(shí)驗(yàn)方法（X-ray末贾、冷凍電鏡、核磁...
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超詳細(xì)教程隧魄！如何下載、安裝和運(yùn)行AlphaFold2 -
安裝基因組注釋流程braker2github鏈接 https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER[https://github.com/Gaius-Augustus/BRA...
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植物轉(zhuǎn)錄因子研究策略及方法植物轉(zhuǎn)錄因子研究 轉(zhuǎn)錄因子（TF）是一類(lèi)具有特殊結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)表蝙，也稱為反式作用因子。通過(guò)與靶基因啟動(dòng)子區(qū)域的順式作用元件特異性結(jié)合乓旗，行使調(diào)控基因表達(dá)的功能。典型的轉(zhuǎn)錄因子...
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Slurm作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)運(yùn)行一汇跨、Slurm常規(guī)運(yùn)行操作在HPC上運(yùn)行任務(wù)的主要方法是通過(guò)sbatch命令提交一個(gè)腳本。例如： sabtch MyJobScript.sh在MyJobScript.sh中的...
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關(guān)鍵基因和hub基因（生物網(wǎng)絡(luò)角度）寫(xiě)在前面 這篇文章仍然來(lái)自幾篇文章及自己平時(shí)的積累穷遂，主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因娱据。很多人誤以為hub基因就是關(guān)鍵基因蚪黑，甚至有人認(rèn)為差異表達(dá)基因就是關(guān)鍵基因。在正式看本文章之前...
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擬時(shí)序分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析之?dāng)M時(shí)序分析簡(jiǎn)介 - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/2f318acfc5c4] 定義 擬時(shí)序分...
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Native PAGE及切膠回收純化實(shí)驗(yàn)方法一、Native-PAGE原理 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(Native-PAGE)是在不加入SDS 疏基乙醇等變性劑的條件下掠剑， 對(duì)保持活性的蛋白質(zhì)進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳，常用...
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公號(hào)：Python大數(shù)據(jù)分析动分，關(guān)注送10G資料
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iPad適合用來(lái)寫(xiě)Python嗎红选？B站上有很多博主拍過(guò)iPad作為生產(chǎn)力的視頻澜公，比如用iPad畫(huà)漫畫(huà)、記筆記喇肋、剪視頻、輕辦公等等蝶防，那么iPad可以用來(lái)寫(xiě)代碼甚侣、跑Python嗎？ 這也是一些初學(xué)Python的小...
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hdWGCNA：?jiǎn)渭?xì)胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細(xì)胞WGCNA分析方法+隨機(jī)森林[https://www.jian...
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干貨錦囊|質(zhì)譜流式抗體選擇小妙招質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù)通常被認(rèn)為是基于熒光流式細(xì)胞術(shù)的改良技術(shù)印荔，其用不同重金屬穩(wěn)定同位素（圖1）代替熒光基團(tuán)來(lái)標(biāo)記不同抗體详羡。然后將單個(gè)細(xì)胞霧化電離仍律，僅保留與相應(yīng)抗體一一對(duì)應(yīng)的金屬離子...
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數(shù)據(jù)分析工具推薦 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多組學(xué)數(shù)據(jù)的交互式工具包批量測(cè)序?qū)嶒?yàn)（單組學(xué)和多組學(xué)）對(duì)于探索廣泛的生物學(xué)問(wèn)題至關(guān)重要实柠。為了促進(jìn)交互式水泉、探索性任務(wù)以及共享易于訪問(wèn)的信息，《Briefings in Bioinformatics》發(fā)...
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MEGA 新版 MEGAX 蛋白質(zhì)序列進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建軟件下載：https://www.megasoftware.net/ 1姿锭、數(shù)據(jù)輸入 2塔鳍、進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建 這就畫(huà)出來(lái)了 調(diào)整成圓形 有點(diǎn)多哈 此外這次分析的蛋白質(zhì)序列呻此，大概這個(gè)樣子
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【文獻(xiàn)報(bào)告】-Molecular diversity and evolution of neuron types in the amniote brain主要探討了脊椎動(dòng)物大腦中神經(jīng)元類(lèi)型的分子多樣性和進(jìn)化。本文使用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)焚鲜，對(duì)澳大利亞蜥蜴Pogona vitticeps（又稱澳大利亞龍）和小鼠的大腦進(jìn)行了單細(xì)胞RN...
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單細(xì)胞WGCNA分析(1)我在前面也分享過(guò)幾篇關(guān)于WGCNA的帖子，其實(shí)WGCNA本身就是對(duì)基因進(jìn)行了加權(quán)共表達(dá)忿磅，合理分組的結(jié)果糯彬。 如果對(duì)于一個(gè)表達(dá)量矩陣，本身就至于2個(gè)分組葱她，WT和處理，那么簡(jiǎn)單的差...
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deeptools工具系列——比較不同bw_bam的信號(hào)差異目錄 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用說(shuō)明1.3 使用實(shí)例 bigwigCompare 工具2.1 使用說(shuō)明2.2 使用實(shí)例 前言 今天主要介紹下...
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通過(guò)空間行為（optimal transport）推斷空間細(xì)胞間通訊信號(hào)方向(COMMOT)作者，Evil Genius 周四了豪墅，變懶了泉手，重申一遍，不要抄襲偶器。 分享文章Screening cell-cell communication in spatial tra...
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單細(xì)胞個(gè)性化分析之轉(zhuǎn)錄因子篇轉(zhuǎn)錄因子(Transcription Factors啡氢，TFs)，是指能夠以特定序列與基因?qū)Ｒ恍越Y(jié)合术裸，從而保證目的基因以特定的強(qiáng)度在特定的時(shí)間與空間表達(dá)的蛋白質(zhì)分子倘是。轉(zhuǎn)錄因子通...
