前言： AlphaFold2在CASP14蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測關(guān)鍵評估大賽中奪得第一名的好成績振峻，其預(yù)測的大部分結(jié)構(gòu)達到了空前的準確度喳魏，與實驗方法（X-ray、冷凍電鏡、核磁...
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超詳細教程侍匙！如何下載、安裝和運行AlphaFold2 -
安裝基因組注釋流程braker2github鏈接 https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER[https://github.com/Gaius-Augustus/BRA...
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植物轉(zhuǎn)錄因子研究策略及方法植物轉(zhuǎn)錄因子研究 轉(zhuǎn)錄因子（TF）是一類具有特殊結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)芙贫，也稱為反式作用因子。通過與靶基因啟動子區(qū)域的順式作用元件特異性結(jié)合傍药，行使調(diào)控基因表達的功能磺平。典型的轉(zhuǎn)錄因子...
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Slurm作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)運行一、Slurm常規(guī)運行操作在HPC上運行任務(wù)的主要方法是通過sbatch命令提交一個腳本拐辽。例如： sabtch MyJobScript.sh在MyJobScript.sh中的...
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關(guān)鍵基因和hub基因（生物網(wǎng)絡(luò)角度）寫在前面 這篇文章仍然來自幾篇文章及自己平時的積累拣挪，主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因。很多人誤以為hub基因就是關(guān)鍵基因俱诸，甚至有人認為差異表達基因就是關(guān)鍵基因菠劝。在正式看本文章之前...
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Native PAGE及切膠回收純化實驗方法一、Native-PAGE原理 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(Native-PAGE)是在不加入SDS 疏基乙醇等變性劑的條件下睁搭， 對保持活性的蛋白質(zhì)進行聚丙烯酰胺凝膠電泳赶诊，常用...
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公號：Python大數(shù)據(jù)分析舔痪，關(guān)注送10G資料
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iPad適合用來寫Python嗎？B站上有很多博主拍過iPad作為生產(chǎn)力的視頻锌唾，比如用iPad畫漫畫锄码、記筆記、剪視頻晌涕、輕辦公等等滋捶，那么iPad可以用來寫代碼、跑Python嗎渐排？ 這也是一些初學(xué)Python的小...
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hdWGCNA：單細胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細胞WGCNA分析方法+隨機森林[https://www.jian...
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干貨錦囊|質(zhì)譜流式抗體選擇小妙招質(zhì)譜流式細胞術(shù)通常被認為是基于熒光流式細胞術(shù)的改良技術(shù)炬太，其用不同重金屬穩(wěn)定同位素（圖1）代替熒光基團來標記不同抗體。然后將單個細胞霧化電離驯耻，僅保留與相應(yīng)抗體一一對應(yīng)的金屬離子...
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數(shù)據(jù)分析工具推薦 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多組學(xué)數(shù)據(jù)的交互式工具包批量測序?qū)嶒灒▎谓M學(xué)和多組學(xué)）對于探索廣泛的生物學(xué)問題至關(guān)重要亲族。為了促進交互式炒考、探索性任務(wù)以及共享易于訪問的信息，《Briefings in Bioinformatics》發(fā)...
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MEGA 新版 MEGAX 蛋白質(zhì)序列進化樹構(gòu)建軟件下載：https://www.megasoftware.net/ 1、數(shù)據(jù)輸入 2涩赢、進化樹構(gòu)建 這就畫出來了 調(diào)整成圓形 有點多哈 此外這次分析的蛋白質(zhì)序列戈次，大概這個樣子
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【文獻報告】-Molecular diversity and evolution of neuron types in the amniote brain主要探討了脊椎動物大腦中神經(jīng)元類型的分子多樣性和進化。本文使用單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)筒扒，對澳大利亞蜥蜴Pogona vitticeps（又稱澳大利亞龍）和小鼠的大腦進行了單細胞RN...
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單細胞WGCNA分析(1)我在前面也分享過幾篇關(guān)于WGCNA的帖子怯邪，其實WGCNA本身就是對基因進行了加權(quán)共表達，合理分組的結(jié)果花墩。 如果對于一個表達量矩陣悬秉，本身就至于2個分組，WT和處理冰蘑，那么簡單的差...
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deeptools工具系列——比較不同bw_bam的信號差異目錄 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用說明1.3 使用實例 bigwigCompare 工具2.1 使用說明2.2 使用實例 前言 今天主要介紹下...
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通過空間行為（optimal transport）推斷空間細胞間通訊信號方向(COMMOT)作者和泌，Evil Genius 周四了，變懶了祠肥，重申一遍武氓，不要抄襲。 分享文章Screening cell-cell communication in spatial tra...
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單細胞個性化分析之轉(zhuǎn)錄因子篇轉(zhuǎn)錄因子(Transcription Factors仇箱，TFs)聋丝，是指能夠以特定序列與基因?qū)Ｒ恍越Y(jié)合，從而保證目的基因以特定的強度在特定的時間與空間表達的蛋白質(zhì)分子工碾。轉(zhuǎn)錄因子通...
