年中總結(jié)接近尾聲掷漱，我們學(xué)習(xí)一些基礎(chǔ)的畫(huà)圖知識(shí) GraphPad prism繪制出來(lái)的圖形有其獨(dú)特的風(fēng)格，并且繪制的圖形也很漂亮息裸，但是正版軟件的售價(jià)很高柿隙，使用破解軟件繪制的圖形...
IP屬地：山東
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基礎(chǔ)繪圖之ggprism包 -
GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）--簡(jiǎn)單快速下載GEO數(shù)據(jù)之前我們已經(jīng)和大家分享過(guò)如何上傳GEO數(shù)據(jù)[http://www.reibang.com/p/40d474378bbb]，同樣，我們也可以從公共數(shù)據(jù)庫(kù)下載其他研究者的數(shù)據(jù)進(jìn)...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘（二）-- 基因差異表達(dá)分析及可視化全套代碼分享前兩次教程“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）簡(jiǎn)單快速下載GEO數(shù)據(jù)[http://www.reibang.com/p/88b5db10f00d]”较沪、“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）下載SRA庫(kù)原...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘（二）基因差異分析數(shù)據(jù)來(lái)源：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
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生信小白一枚萄焦，我不是牛人控轿，我只是一頭開(kāi)荒牛，希望大家能在我的學(xué)習(xí)基礎(chǔ)上更進(jìn)一步拂封，共同提高茬射！
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GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）數(shù)據(jù)下載及基因ID轉(zhuǎn)換
數(shù)據(jù)來(lái)源：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
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13.GEO數(shù)據(jù)集的R語(yǔ)言差異分析和代碼解析--2.差異分析一、舉例回顧 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集冒签，使用limma包進(jìn)行差異分析舉例在抛。 GSE1009 樣本量：共6個(gè)樣本，其中后3個(gè)為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本萧恕，前3個(gè)為正常腎小...
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12.GEO數(shù)據(jù)集的R語(yǔ)言差異分析和代碼解析—1.數(shù)據(jù)下載和整理一刚梭、舉例介紹 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集，使用limma包進(jìn)行差異分析舉例票唆。 GSE1009 樣本量：共6個(gè)樣本朴读，其中3個(gè)為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本，另3個(gè)為正常腎小球...
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GEO數(shù)據(jù)表達(dá)差異分析1-1從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載數(shù)據(jù) 1-2提取表達(dá)矩陣exp 1-3提取各樣本的分組信息 1-4調(diào)整exp的行名順序與pd列名完全一致 1-5提取芯片平臺(tái)編號(hào)走趋，保存 2-1提取分組...
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零基礎(chǔ)學(xué)生信入門(mén)筆記(R語(yǔ)言衅金、Linux、Python簿煌、RNA-seq氮唯、單細(xì)胞測(cè)序、質(zhì)譜流式姨伟、TCGA惩琉、GEO、單細(xì)胞經(jīng)典文獻(xiàn)解讀)
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語(yǔ)言授滓？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語(yǔ)言[https://www...
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GEO2R差異表達(dá)分析軟件前兩天我們對(duì)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)了一個(gè)大致的介紹琳水。我們對(duì)于目標(biāo)數(shù)據(jù)集肆糕，我們做的第一個(gè)事情就是差異分析，來(lái)尋找有差異的結(jié)果在孝。所有的表達(dá)芯片做的差異表達(dá)分析都是基于limma的算法來(lái)的...
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生信log14|生信自學(xué)不求人-靠譜學(xué)習(xí)資料總結(jié)和評(píng)價(jià)生信學(xué)習(xí)資料 自學(xué)生信不求人私沮，現(xiàn)在網(wǎng)上資料越來(lái)越豐富始赎，但是資料多也意味著魚(yú)龍混雜，并且讓人無(wú)從選擇仔燕。正確做法應(yīng)該是造垛，找一個(gè)適合自己且完善靠譜的學(xué)習(xí)資料，從頭到尾跟一遍晰搀，代碼敲...
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生信log44|生信就是跑流程嗎五辽？
在求學(xué)階段，經(jīng)常聽(tīng)到老師或者沒(méi)有做生信的同學(xué)說(shuō)生信就是跑流程的外恕，一些大佬也有發(fā)文自嘲和解釋過(guò)生信不是跑流程杆逗。我自己在剛上手生信分析時(shí)，對(duì)這個(gè)說(shuō)法強(qiáng)烈反對(duì)鳞疲，參加工作或者說(shuō)上手多...
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我要偷偷內(nèi)卷尚洽，然后驚艷所有人悔橄！
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生信 | 生信人搭建數(shù)據(jù)庫(kù)的學(xué)習(xí)流程
寫(xiě)在前面 目前各種組學(xué)培訓(xùn)開(kāi)展的如火如荼，卻鮮有生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)搭建的相關(guān)教程和學(xué)習(xí)流程腺毫。原因有以下幾個(gè)： 1.學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫(kù)的搭建付出多癣疟，回報(bào)少。有這功夫應(yīng)該可以把大部分組學(xué)知...
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生信技能樹(shù)：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客澈灼，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者店溢、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專(zhuān)題叁熔，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記床牧，我們需要你荣回，將本專(zhuān)題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)戈咳。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集心软、整理壕吹，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類(lèi)算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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Biobanks知多少隨著一批國(guó)家的生物銀行的完成和結(jié)果公布耳贬，多個(gè)Biobank的GWAS summary statistics文件已經(jīng)公開(kāi)，這里列下不同國(guó)家的相關(guān)資源猎唁，這些資源基本是使用開(kāi)源的p...
