年中總結(jié)接近尾聲，我們學(xué)習(xí)一些基礎(chǔ)的畫圖知識 GraphPad prism繪制出來的圖形有其獨特的風(fēng)格，并且繪制的圖形也很漂亮墩划，但是正版軟件的售價很高芽死，使用破解軟件繪制的圖形...
IP屬地：山東
-
基礎(chǔ)繪圖之ggprism包 -
GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）--簡單快速下載GEO數(shù)據(jù)之前我們已經(jīng)和大家分享過如何上傳GEO數(shù)據(jù)[http://www.reibang.com/p/40d474378bbb]约谈，同樣岛都，我們也可以從公共數(shù)據(jù)庫下載其他研究者的數(shù)據(jù)進...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘（二）-- 基因差異表達分析及可視化全套代碼分享前兩次教程“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）簡單快速下載GEO數(shù)據(jù)[http://www.reibang.com/p/88b5db10f00d]”蚤认、“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）下載SRA庫原...
-
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘（二）基因差異分析數(shù)據(jù)來源：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
-
生信小白一枚履植，我不是牛人，我只是一頭開荒牛悄晃，希望大家能在我的學(xué)習(xí)基礎(chǔ)上更進一步玫霎，共同提高！
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）數(shù)據(jù)下載及基因ID轉(zhuǎn)換
數(shù)據(jù)來源：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
-
13.GEO數(shù)據(jù)集的R語言差異分析和代碼解析--2.差異分析一妈橄、舉例回顧 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集庶近，使用limma包進行差異分析舉例。 GSE1009 樣本量：共6個樣本眷细，其中后3個為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本拦盹，前3個為正常腎小...
-
12.GEO數(shù)據(jù)集的R語言差異分析和代碼解析—1.數(shù)據(jù)下載和整理一、舉例介紹 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集溪椎，使用limma包進行差異分析舉例普舆。 GSE1009 樣本量：共6個樣本恬口，其中3個為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本，另3個為正常腎小球...
-
GEO數(shù)據(jù)表達差異分析1-1從GEO數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù) 1-2提取表達矩陣exp 1-3提取各樣本的分組信息 1-4調(diào)整exp的行名順序與pd列名完全一致 1-5提取芯片平臺編號沼侣，保存 2-1提取分組...
-
零基礎(chǔ)學(xué)生信入門筆記(R語言祖能、Linux、Python蛾洛、RNA-seq养铸、單細胞測序、質(zhì)譜流式轧膘、TCGA钞螟、GEO、單細胞經(jīng)典文獻解讀)
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語言谎碍？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語言[https://www...
-
GEO2R差異表達分析軟件前兩天我們對GEO數(shù)據(jù)庫來了一個大致的介紹鳞滨。我們對于目標數(shù)據(jù)集，我們做的第一個事情就是差異分析蟆淀，來尋找有差異的結(jié)果拯啦。所有的表達芯片做的差異表達分析都是基于limma的算法來的...
-
-
生信log14|生信自學(xué)不求人-靠譜學(xué)習(xí)資料總結(jié)和評價生信學(xué)習(xí)資料 自學(xué)生信不求人褒链，現(xiàn)在網(wǎng)上資料越來越豐富，但是資料多也意味著魚龍混雜疑苔，并且讓人無從選擇甫匹。正確做法應(yīng)該是，找一個適合自己且完善靠譜的學(xué)習(xí)資料夯巷，從頭到尾跟一遍赛惩，代碼敲...
-
生信log44|生信就是跑流程嗎哀墓？
在求學(xué)階段趁餐，經(jīng)常聽到老師或者沒有做生信的同學(xué)說生信就是跑流程的，一些大佬也有發(fā)文自嘲和解釋過生信不是跑流程篮绰。我自己在剛上手生信分析時后雷，對這個說法強烈反對，參加工作或者說上手多...
-
我要偷偷內(nèi)卷，然后驚艷所有人贾漏！
-
生信 | 生信人搭建數(shù)據(jù)庫的學(xué)習(xí)流程
寫在前面 目前各種組學(xué)培訓(xùn)開展的如火如荼候学，卻鮮有生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫搭建的相關(guān)教程和學(xué)習(xí)流程。原因有以下幾個： 1.學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫的搭建付出多纵散，回報少梳码。有這功夫應(yīng)該可以把大部分組學(xué)知...
-
生信技能樹：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA掰茶，技術(shù)文檔與博客暇藏，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡書創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者濒蒋、愛好者以及相關(guān)編程人員加入本專題盐碱，貢獻你的文字，無論是原創(chuàng)還是筆記沪伙，我們需要你瓮顽，將本專題打造為生信知識寶庫、交流平臺围橡。 內(nèi)容可以是對生物信息學(xué)與算法知識相關(guān)資源的收集趣倾、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計 * 計算生物學(xué) * 各類算法 * 機器學(xué)習(xí)
-
-
Biobanks知多少隨著一批國家的生物銀行的完成和結(jié)果公布，多個Biobank的GWAS summary statistics文件已經(jīng)公開黔漂，這里列下不同國家的相關(guān)資源诫尽，這些資源基本是使用開源的p...
