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@Bio_Infor 您好蔼紧！今天才看到您的推文俭嘁，正在學(xué)習(xí)單細(xì)胞拨拓，請問能夠分享復(fù)現(xiàn)的全部流程嗎肴颊？我想學(xué)習(xí)一下

單細(xì)胞分析踩坑實錄：DotPlot()之'RNA' assay還是 'integrated' assay?

前段時間在生信技能樹單細(xì)胞學(xué)習(xí)小分隊分享單細(xì)胞文章復(fù)現(xiàn)，一不小心就踩了一個坑……記錄在這兒和大家一起分享渣磷。 背景 主要是想復(fù)現(xiàn)2020年發(fā)表在 PNAS 上的一篇題為 Sin...

Bio_Infor

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af1812ec6a72

請問逐样，SCTtransform 預(yù)處理默認(rèn)是選取3000基因蜗字，做基因可視化時如果基因不在這3000個基因中，是不是還是得用RNA assay呢脂新？

sctransform預(yù)處理后挪捕，如何進(jìn)行差異表達(dá)分析

一、seurat執(zhí)行差異表達(dá)分析 根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)預(yù)處理的方式不同（lognormalize和sctransform）争便，執(zhí)行差異表達(dá)分析代碼有所不同级零，這個需要注意。我當(dāng)時請教過...

whitebird

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af1812ec6a72

你好，請問想要看基因在各細(xì)胞系的表達(dá)需要下載哪個數(shù)據(jù)?read.count數(shù)據(jù)嗎憨颠？

CCLE：求任意基因的相關(guān)性

進(jìn)行腫瘤的研究胳徽，求兩個或多個基因的相關(guān)性，可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理爽彤，如果能再加上細(xì)胞系的相關(guān)性就能完美了养盗。下面就分享下，手動下載CCLE測序數(shù)據(jù)适篙，求任意...

高大石頭

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