發(fā)簡信
IP屬地：遼寧
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這個世界流行離開冤灾，但我們卻不擅長告別
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@Bio_Infor 您好！今天才看到您的推文，正在學(xué)習(xí)單細胞兵拢，請問能夠分享復(fù)現(xiàn)的全部流程嗎？我想學(xué)習(xí)一下
單細胞分析踩坑實錄：DotPlot()之'RNA' assay還是 'integrated' assay?
前段時間在生信技能樹單細胞學(xué)習(xí)小分隊分享單細胞文章復(fù)現(xiàn)逾礁，一不小心就踩了一個坑……記錄在這兒和大家一起分享说铃。 背景 主要是想復(fù)現(xiàn)2020年發(fā)表在 PNAS 上的一篇題為 Sin...
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南京大學(xué)生物學(xué)腻扇，佛系更新~
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北京中醫(yī)藥大學(xué)博士幼苛，一個會科研的中醫(yī)大夫
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請問舶沿，SCTtransform 預(yù)處理默認是選取3000基因舌剂，做基因可視化時如果基因不在這3000個基因中，是不是還是得用RNA assay呢暑椰？
sctransform預(yù)處理后霍转，如何進行差異表達分析
一、seurat執(zhí)行差異表達分析 根據(jù)單細胞數(shù)據(jù)預(yù)處理的方式不同（lognormalize和sctransform）一汽，執(zhí)行差異表達分析代碼有所不同避消，這個需要注意。我當(dāng)時請教過...
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青山卷白云，留酌待情人
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公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組渔扎、腫瘤免疫硫狞、單細胞組學(xué)
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努力努力再努力~<br>個人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生旁瘫。
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珠江醫(yī)院腫瘤科簡書號，同時也歡迎大家關(guān)注我們的微信號惠况！
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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你好稠屠，請問想要看基因在各細胞系的表達需要下載哪個數(shù)據(jù)?read.count數(shù)據(jù)嗎峦睡？
CCLE：求任意基因的相關(guān)性
進行腫瘤的研究翎苫，求兩個或多個基因的相關(guān)性，可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理榨了，如果能再加上細胞系的相關(guān)性就能完美了煎谍。下面就分享下，手動下載CCLE測序數(shù)據(jù)龙屉，求任意...
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好記性不如爛筆頭转捕，溫故而知新作岖。踏實一些，不要著急五芝，你想要的歲月都會給你痘儡！
