發(fā)簡(jiǎn)信
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WGCNA分析 | 全流程代碼分享 | 代碼二--關(guān)于WGNCA的教程，本次的共有三期教程摊唇，我們同時(shí)做了三個(gè)分析的比較咐蝇，差異性相對(duì)還是比較大的，詳情可看WGCNA分析 | 你的數(shù)據(jù)結(jié)果真的是準(zhǔn)確的嗎巷查？有序？[https://...
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擬南芥轉(zhuǎn)化技巧Tips for arabidopsis transformation[https://blog.addgene.org/tips-for-arabidopsis-trans...
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從擬南芥的T0123代獲得純合株系盅称，轉(zhuǎn)基因必經(jīng)之路肩祥！作為模式生物，擬南芥（Arabidopsisthaliana）主要有以下幾方面的優(yōu)勢(shì)： 第一缩膝，擬南芥的基因組在常見(jiàn)的植物模型中是最小的混狠，染色體數(shù)目也很少，只有五對(duì)同源染色...
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構(gòu)建某一基因家族的進(jìn)化樹(shù)
寫(xiě)在前面繪制某一基因家族的進(jìn)化樹(shù)疾层，這是基因組學(xué)研究過(guò)程中不可缺少的一部分将饺。劃分成不同的基因家族的依據(jù)一般是其具有某一相同的結(jié)構(gòu)域，下面我將以水稻中GUB_WAK_bind類家...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之時(shí)序分析（maSigPro包）在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析過(guò)程中，我們最常做的是不同處理方式的樣本之間的比較（Treated vs Control）湖饱，這時(shí)候我們采用“DEG分析+pathway分析”的方式就可基本完成...
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無(wú)參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無(wú)參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類： 有參比對(duì)—定量—差異分析—功能富集分析等 無(wú)參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無(wú)參考轉(zhuǎn)錄組序列...
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轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（reads比對(duì)）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（reads的比對(duì)與samtoo...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一蝇恶、 首先放一段illumina測(cè)序平臺(tái)的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm[https://www.bi...
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重組質(zhì)粒的構(gòu)建（含引物設(shè)計(jì)）本文以白細(xì)胞介素6為例撮弧，介紹基因工程重組質(zhì)粒構(gòu)建的一般步驟潘懊。 1.準(zhǔn)備 本文使用到的兩個(gè)軟件為Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
1 反應(yīng)體系： 2*Phanta max master mix：25ulR：2ul（10uM）F：2ul（10uM）cDNA：21ul（稀釋過(guò)的） 2 反應(yīng)條件： 95℃ 3...
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表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建之引物設(shè)計(jì)比如我現(xiàn)在需要表達(dá)FUS這個(gè)蛋白授舟，首先我要確定FUS的CDS區(qū)序列，使用NCBI即可獲得贸辈； 可以看出FUS有三個(gè)同源異構(gòu)體释树，我們以第一個(gè)X1為例來(lái)說(shuō)明； 這是其CDS區(qū)序列信...
