240 發(fā)簡信
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    生信步驟|kmc+genomescope進行基因組調(diào)查

    在組裝未知基因組時殖蚕,往往需要利用重測序數(shù)據(jù)提前進行基因組調(diào)查锐膜,以獲取其基因組規(guī)模,雜合率,重復(fù)序列比例值骇,GC含量等信息莹菱。從而更好地擬定后繼測序策略±卓停基因組調(diào)查可以采用kmer...

  • GWAS分析-說人話(22)-"最終章"

    前言 “天下沒有不散的筵席”~ 正如開章所說“這個年代嫂易,誰?還有人做GWAS靶峙蟆?怜械!” 也沒有想到這個系列是最受歡迎的颅和, 親們所看到1-21章操作出來的文章,今天的狀態(tài)更新了 ...

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    原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中,編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI蓉冈,要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗的不要慌城舞,小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI (一)NCBI賬號:上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...

  • 用python合并RepeatMasker預(yù)測結(jié)果中染色體的overlap區(qū)域

    前言 RepeatMasker是一個通過已有數(shù)據(jù)庫預(yù)測重復(fù)序列的軟件椿争,可以篩選DNA序列中的散在重復(fù)序列和低復(fù)雜序列,是重復(fù)序列注釋的重要軟件熟嫩。 問題 我們想對RepeatM...

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    用python做生物信息數(shù)據(jù)分析(2-pysam)

    寫perl的思維秦踪,可能確實不能拿來學(xué)python。畢竟,python的褲子有很多椅邓。面向?qū)ο蟮恼Z言柠逞,如果不好好穿褲子,怎么找對象景馁?板壮。手上要做的事情,需要解析sam合住,更或者bam...

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    植物啟動子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析

    寫在前面 以前總看到問題是绰精,基因結(jié)構(gòu)可視化的問題;現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預(yù)測或者說可視化透葛。這本身比較簡單笨使,也比較玄乎,所以我一直不是太樂意與別人討論僚害。但學(xué)院今天斷網(wǎng)硫椰,手上的...

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