DAPI濃度為1ug/ul舀患，染色時1000倍稀釋
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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流式筆記 2019.5.16
實驗準備 1. 細胞染色 2. 檢查鞘液（雙蒸水）晌区、廢液 3. 開機流程 4. 設置通道 上機實驗 1. blank 2. 單標管（以三色為例） 調補償 3. 實驗管 4....
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浙江大學八年制醫(yī)學生
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不想再用慢病毒了，我還有什么別的選擇嗎瑟蜈？piggyBac transposon慢病毒可快速爽哎、高效的將目的基因整合到宿主細胞基因組，非常適合用于構建穩(wěn)轉細胞株。但慢病毒也有缺點捐腿，即使是穩(wěn)轉細胞株纵朋，可能會隨著傳代次數(shù)的增加而慢慢丟失干擾或者過表達的效率。其...
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我只是知識的搬運工~
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CRISPR-Cas9基因編輯4--確定Cas9質粒構建成功+漂亮的質粒轉染簡介和前期文章 我對之前的所有教程進行了再次詳細的總結CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設計（上）[http://www.reibang.com/p/e5c...
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本小推車專門推各種perl相關的基本語法介紹，資源涯呻，應用凉驻。特別是與生物信息學應用相關的文章。 ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的复罐，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看涝登。 ?? perl基本語法，比如和python語法的區(qū)別 ?? perl上下文效诅，比如將列表賦值給標量會發(fā)生什么 ?? perl特殊變量胀滚，比如$_ $/ $\ ?? perl入門，比如循環(huán)乱投，常見的正則使用等 ?? perl進階咽笼，比如引用，比如map grep等 ?? perl高級戚炫，比如命名空間剑刑，繼承，閉包等 ?? perl的單行程序双肤，比如與linux的各個工具搭配 ?? perl常用模塊施掏，比如File::Basename Yaml ?? perl繪圖，比如svg模塊茅糜，GD模塊七芭，circos工具等等 ?? perl與生物信息學之間的關系，比如用perl提取genbank ?? perl6的相關用法（生信不太建議學perl6） 備注：本文很多的文章也可在 JSON_NULL 的專題 『碼神之路：perl篇』 中找到蔑赘。這個專題對我的幫助很大狸驳，感謝這位簡友
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一些生物信息學用到的軟件，工具究西，介紹用法安裝以及以及應用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades窗慎、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie卤材、diamond等 ?? 多序列比對比如mega遮斥、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉化的samtools扇丛、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS术吗、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL帆精、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結構變異或者SNP序列GATK较屿、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質量評估的FastQC卓练、BUSCO隘蝎、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit襟企、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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記錄學習生信的點滴
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收集一些生物信息學的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程汇跨！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題务荆，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了妆距。望見諒穷遂！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看娱据。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質免疫共沉淀技術ATAC-Seq蚪黑、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節(jié)的比如熱圖盅惜、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl忌穿、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用抒寂，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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生信技能樹：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術文檔與博客盯拱，需要你的參與盒发。 ……………………………… 歡迎在簡書創(chuàng)作和做筆記的生信學習者、愛好者以及相關編程人員加入本專題狡逢，貢獻你的文字宁舰，無論是原創(chuàng)還是筆記，我們需要你奢浑，將本專題打造為生信知識寶庫明吩、交流平臺。 內容可以是對生物信息學與算法知識相關資源的收集殷费、整理印荔，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計 * 計算生物學 * 各類算法 * 機器學習
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生物信息-編程練習題學習01參考學習資料：https://mp.weixin.qq.com/s/n-C2P322ZWQyZ6-3EEKbxA經(jīng)常看到群里會有一些題目详羡，然后都不知道怎么去做仍律，先來學習一下前...
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小劉哥水泉，農(nóng)民、生信民工窒盐、程序員草则、理想主義者
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Python基礎
〇、前言 本文共108張圖蟹漓，流量黨請慎重炕横！ 歷時1個半月，我把自己學習Python基礎知識的框架詳細梳理了一遍葡粒。 一方面份殿，我堅信實踐總是記得牢一些膜钓，總結每一個知識點的時候我要...
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Python學習交流 技術分享
