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    群體適應(yīng)性分析——選擇信號(hào)

    ●選擇信號(hào):生物在自然選擇或人工選擇過程中,由于選擇作用在基因組上留下的遺傳多態(tài)性降低、連鎖不平衡等選擇印記绍申。●選擇性清除(selective sweep):受選擇基因座位的...

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    群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全

    基因流(也稱基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)勋磕,從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成高镐。通過基因交流向群體中引入新的等位基因脉课,是遺傳變異一個(gè)非常重要的來源目养,...

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    StringTie + DESeq2 進(jìn)行 RNA-seq 差異基因分析

    按:RNA-seq 流程非常多樣化碘梢,每一個(gè)步驟可選工具都非常多。我的選擇是 StringTie 進(jìn)行組裝取得 read counts 數(shù)值伐蒂,DESeq2 分析差異基因煞躬。這里把...

  • 如何構(gòu)建SNPs-based phylogenetic tree

    如果根據(jù)SNP或者Indel 構(gòu)建其系統(tǒng)進(jìn)化樹融虽,可以展示群體中不同個(gè)體的相互關(guān)系,基因變異相似的往往會(huì)在同一個(gè)樹的cluster中灼芭,一顆好的樹可以給你一個(gè)群體大概的分類(你這...

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    可重復(fù)的生信分析系列一:Docker的介紹

    可重復(fù)的生信分析一直是未來的趨勢巍佑。如果實(shí)現(xiàn)可重復(fù)的生信分析,關(guān)鍵在于分析軟件版本的控制寄悯,一致的環(huán)境設(shè)置還有良好的分析流程的記錄萤衰。最近發(fā)現(xiàn)一篇關(guān)于這方面很好的教程。改教程主要分...

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