IP屬地：湖北
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研究方向：基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、遺傳學(xué)<br>邊做邊分享糠溜，超不定期更新
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生物信息學(xué)專業(yè)<br>公眾號：生信學(xué)習(xí)手冊
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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)，生物信息學(xué)蓖乘，碩士
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個人記錄而已嘉抒，不盈利零聚，不保證對錯，不回簡信
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感謝作者些侍，很有幫助
Cmake升級詳細(xì)步驟
1.查看當(dāng)前版本隶症，并卸載 #cmake --version sudo yum remove cmake cmake-data 2.獲取新版本源碼 wget https://c...
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公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研狈定，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組颂龙、腫瘤免疫习蓬、單細(xì)胞組學(xué)
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小劉哥躲叼，農(nóng)民、生信民工企巢、程序員枫慷、理想主義者
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群體遺傳中基于SNP的PCA分析
基于群體遺傳中變異信息文件VCF來分析PCA 第一種方法 可以使用plink軟件直接進(jìn)行分析 plink --vcf all_genotypegvcf_filter_remo...
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GATK做變異檢測
一、測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 新建工作目錄浪规，GATK-analysis 新建data文件夾或听；mkdir data 1.1 公司返回的測序下機(jī)數(shù)據(jù) 例如：6個NGS測序樣本；Raw da...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題足丢，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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畢業(yè)于山東大學(xué)斩跌，具有6年生物信息分析工作經(jīng)驗，一直從事動植物及人的重測序方向捞慌。擅長群體重測序及GWAS分析耀鸦；進(jìn)行過NIPT，CNV啸澡，腫瘤ctDNA袖订，遺傳腫瘤等人類健康方向相關(guān)的分析；使用linux嗅虏，perl著角，R，git等
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群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號的檢測及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控旋恼、比對吏口，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程冰更，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上）产徊，還有Samtools+bcf...
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GWAS分析-說人話（14）- 如何查看SNP的基因型
前言 這年頭，誰還TM的做GWAS～ 今天導(dǎo)師不是想和你看流星雨蜀细， 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數(shù)據(jù)中的基因型....... 怎么辦舟铜？ I have 一堆SNPs，...
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VCF格式的學(xué)習(xí)及對VCF文件的統(tǒng)計
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的學(xué)習(xí) 1.什么是vcf奠衔？VCF是用于描述SNP谆刨，INDEL和SV結(jié)果的文本文件塘娶。在GATK軟件中得到最好...
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3. SNP Calling以GATK流程為例，簡單來說痊夭，SNP Calling主要包括以下幾步： 1. 給參考基因組建立索引：samtools faidx刁岸、bwa index, gatk Create...
