WGCNA:加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,簡(jiǎn)而言之,就是將基因劃分為若干個(gè)模塊,探究與表型數(shù)據(jù)與基因模塊之間的相關(guān)關(guān)系,并找到模塊中的核心基因。 適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)模式,推薦5組(或...
WGCNA:加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,簡(jiǎn)而言之,就是將基因劃分為若干個(gè)模塊,探究與表型數(shù)據(jù)與基因模塊之間的相關(guān)關(guān)系,并找到模塊中的核心基因。 適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)模式,推薦5組(或...
[連鎖不平衡粗俗的說就是:這幾個(gè)基因耍流氓,喜歡抱團(tuán)遺傳痰哨,不再隨機(jī)胶果。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上,隨著物理距離的增大斤斧,兩個(gè)連鎖的的等位基因的連鎖程度不斷減小早抠。] LD衰減圖...
大佬牛逼
全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料(GWAS tutorial)20210313更新版時(shí)隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程撬讽,后續(xù)如果新出教程的話會(huì)一直更新蕊连。 同時(shí)感謝多年陪伴我成長(zhǎng)、一直默默關(guān)注我的「你們」~ by 「橙子牛奶糖(陳文燕)」 1....
時(shí)隔一年多游昼,于今日(20210313)再次更新教程甘苍,后續(xù)如果新出教程的話會(huì)一直更新。 同時(shí)感謝多年陪伴我成長(zhǎng)烘豌、一直默默關(guān)注我的「你們」~ by 「橙子牛奶糖(陳文燕)」 1....
比較基因組學(xué) 比較基因組學(xué)(Comparative genomics):是基于基因組圖譜和測(cè)序技術(shù),對(duì)已知的基因特征和基因組結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較以了解基因的功能廊佩、表達(dá)機(jī)制和不同物種親...
RNA-seq即轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)料皇,就是把mRNA谓松,smallRNA等用高通量測(cè)序技術(shù)把它們的序列測(cè)出來星压,反映出它們的表達(dá)水平。 mRNA:信使message RNA是由DNA的...
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)原理的書籍或者文章推薦。 其實(shí)我個(gè)人覺得拧簸,做這個(gè)分析,先從跑流程開始男窟,再去看原理盆赤。 為什么這么說呢,因?yàn)閷?duì)于初學(xué)者來說歉眷,...
作者:Philip Yang 鏈接:https://www.zhihu.com/question/27695566/answer/40741777 來源:知乎 著作權(quán)歸作者所...
1.QTL:Quantitative Trait Loci淑际,概念自己查,說的是基因型和snp位點(diǎn)的關(guān)系扇住,多用于單一種群春缕,遺傳背景簡(jiǎn)單的,避免受population struc...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通過對(duì)多個(gè)表型相似的GWAS summary結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合分析宅荤,發(fā)現(xiàn)更多的表型相關(guān)基因座。以抑郁癥狀...