WGCNA：加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析绿饵，簡而言之荸型，就是將基因劃分為若干個模塊岭妖，探究與表型數(shù)據(jù)與基因模塊之間的相關(guān)關(guān)系想括，并找到模塊中的核心基因碰镜。 適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)模式牢撼，推薦5組(或...
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WGCNA（1）：R包安裝及數(shù)據(jù)導入清洗 -
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連鎖不平衡以及連鎖不平衡衰減[連鎖不平衡粗俗的說就是：這幾個基因耍流氓咖驮，喜歡抱團遺傳边器，不再隨機训枢。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上，隨著物理距離的增大饰抒，兩個連鎖的的等位基因的連鎖程度不斷減小肮砾。] LD衰減圖...
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大佬牛逼
全基因組關(guān)聯(lián)分析學習資料（GWAS tutorial）20210313更新版
時隔一年多，于今日（20210313）再次更新教程袋坑，后續(xù)如果新出教程的話會一直更新仗处。 同時感謝多年陪伴我成長、一直默默關(guān)注我的「你們」~ by 「橙子牛奶糖（陳文燕）」 1....
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基因組與比較基因組專題（前言）
比較基因組學 比較基因組學（Comparative genomics）：是基于基因組圖譜和測序技術(shù),對已知的基因特征和基因組結(jié)構(gòu)進行比較以了解基因的功能翅娶、表達機制和不同物種親...
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RNA-seq學習：No.1什么是RNA-seq？RNA-seq即轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)蜕提，就是把mRNA森书，smallRNA等用高通量測序技術(shù)把它們的序列測出來，反映出它們的表達水平谎势。 mRNA：信使message RNA是由DNA的...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析學習資料（GWAS tutorial）
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）原理的書籍或者文章推薦脏榆。 其實我個人覺得猖毫，做這個分析，先從跑流程開始姐霍，再去看原理鄙麦。 為什么這么說呢，因為對于初學者來說镊折，...
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2019-02-23 QTL（轉(zhuǎn)自知乎）作者：Philip Yang 鏈接：https://www.zhihu.com/question/27695566/answer/40741777 來源：知乎 著作權(quán)歸作者所...
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2022-09-05 | 關(guān)于QTL恨胚，GWAS之間的關(guān)系以及其衍生概念
1.QTL:Quantitative Trait Loci，概念自己查炎咖，說的是基因型和snp位點的關(guān)系赃泡，多用于單一種群寒波，遺傳背景簡單的，避免受population struc...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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GWAS：mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用：通過對多個表型相似的GWAS summary結(jié)果進行聯(lián)合分析页屠，發(fā)現(xiàn)更多的表型相關(guān)基因座。以抑郁癥狀...
