探序基因腫瘤研究院 整理 作者安裝好了centos8葬凳,并安裝了R-4.3.2,通過install.paclages("Seurat")自動安裝Seurat包归敬。運(yùn)行了很久很久后...
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一邊學(xué)習(xí)撇眯,一邊總結(jié),一邊分享! 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一[https://mp.weixin.qq.com/s/M0LAlE-6...
一.安裝 RStudio Server RStudio下載地址:http://rstudio.org/download/[http://rstudio.org/downloa...
salmon是一款不基于比對而直接對基因進(jìn)行定量的工具瑞凑,適用于轉(zhuǎn)錄組末秃、宏基因組等分析。其優(yōu)勢是: 定量時考慮到不同樣品中基因長度的改變(比如不同isoform的使用) 速度快...
使用官方推薦的安裝命令 產(chǎn)生如下奇怪的glibc沖突 可是明明2.31大于2.17版本啊,經(jīng)過查閱篱蝇,發(fā)現(xiàn)可能是conda同時搜索conda-forge和default庫產(chǎn)生沖...
參考1:http://www.reibang.com/p/68f7b663c5ff[http://www.reibang.com/p/68f7b663c5ff]參考2:h...
BioSciTools https://bioscitools.github.io[https://bioscitools.github.io]基于Java (JDK-11)...
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切 STAR比對的特點(diǎn): 速度快 準(zhǔn)確度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多個比對共享...
The evolution of gene expression levels in mammalian organs[https://pubmed.ncbi.nlm.nih...
1. synteny 和 collinearity 用來描述基因組的共線性 synteny 共線性:同源基因在相應(yīng)染色體上的保留collinearity 同線性:在synte...
今天分享最近發(fā)表的另外一篇文獻(xiàn)零截,還是棉花棉纖維研究的麸塞,最近棉花的單細(xì)胞文章還真是多,扎堆發(fā)表了涧衙。 棉纖維的重要性哪工,我就不多做敘述了,我也查百度弧哎,就不粘貼了雁比。circadida...
使用單拷貝基因畫物種進(jìn)化樹 所需軟件: 步驟: python 腳本更改物種蛋白序列的ID 2)更改各個物種蛋白庫文件的名字,與序列ID的名字前半部分一致撤嫩;例如Amborell...
今天我們要復(fù)現(xiàn)的是一篇SCI文章的配對連線箱線圖,配對箱線圖序攘、或者說配對連線圖我們之前有寫過(ggplot做分組配對連線圖[http://mp.weixin.qq.com/s...
參考:zhuanlan.zhihu.com/p/27162794 www.cookbook-r.com/Graphs/Output_to_a_file/ blog.scien...
中心法則: 蛋白相關(guān)實(shí)驗(yàn): 基因結(jié)構(gòu): 研究思路: https://www.bilibili.com/video/BV1Sv4y117ZP/?spm_id_from=page...