圖形泛基因組（圖泛）以節(jié)點和路徑的形式存儲和展示物種的變異信息，關(guān)鍵作用是擴展線性參考基因組的坐標(biāo)系統(tǒng)晚伙，以容納更多的遺傳多樣性區(qū)域蒋歌。本文首先總結(jié)了圖泛構(gòu)建方法庶香，然后討論了圖泛...
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植物圖形泛基因組Graph-based pan-genome -
入門必看 | 深度解析長末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs）（轉(zhuǎn)發(fā)）入門必看 | 深度解析長末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs） 諾禾致源[http://www.reibang.com/u/ee00dc6faab7]已關(guān)注 0.54220...
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熱圖去掉聚類樹但是保留聚類
看到這個問題丑慎，你可能搜了好多答案裹唆，比如 熱圖如何去掉聚類樹的同時保留聚類的順序号杏？ - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/e...
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最全bcftools使用說明--只看本文就夠了1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合婴氮，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件。它可以接受VCF格式盾致、壓縮的VCF格式以及BCF格式主经，并能自動檢測輸入的格...
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[R語言] 單因素方差分析和多重比較示例數(shù)據(jù)集如下： 導(dǎo)入數(shù)據(jù)作簡單可視化 正態(tài)性檢驗 當(dāng)分析小于50行的小樣本數(shù)據(jù)時，用Shapiro-Wilk 檢驗 當(dāng)分析大于50行的大樣本數(shù)據(jù)時庭惜，用Kolmogorov-...
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WGCNA學(xué)習(xí)：WGCNA分析原理本教程根據(jù)PlantTech的WGCNA課程編寫护赊，課程還是不錯的惠遏，所以將該課程給大家分享一下。 WGCNA筆記第一彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實...
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應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時候，大家得到的序列都是單個基因的長度判耕，所以一般都是逐個基因的比較透绩，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方...
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MUMMER 兩個基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時候，大家得到的序列都是單個基因的長度，所以一般都是逐個基因的比較渺贤，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
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小技巧4-控制繪圖區(qū)大谐浮（ggplot2）
基于ggplot2的繪圖導(dǎo)出時，可以指定整張圖像的大小志鞍，這里不做贅述瞭亮。 本文所指繪圖區(qū)是指坐標(biāo)軸之間的繪圖區(qū)，不含圖例區(qū)固棚，標(biāo)題區(qū)统翩，標(biāo)簽區(qū)。即橫縱坐標(biāo)之間框柱的區(qū)域此洲。 導(dǎo)出單張...
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同源染色體片段檢測工具ColinearScan的使用寫在前面 更好的閱讀體驗請移步這里厂汗。確定染色體同源片段是基因組學(xué)研究的一個重要方面，有助于揭示基因組在歷史上發(fā)生的多種多樣的進(jìn)化事件呜师，如DNA復(fù)制娶桦、染色體重排、基因丟失等汁汗。研...
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2021-08-19WGCNA確定目標(biāo)模塊后如何找模塊內(nèi)的hubgene
WGCNA 分析確定重要模塊之后衷畦，如何找模塊內(nèi)的hubgene？ 想找hubgene,必須先理解其概念：網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置的點（基因）知牌。在WGCNA中祈争，由于進(jìn)行了無尺度化處理...
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單細(xì)胞系列課程-10 Trajectory inference analysis of scRNA-seq data視頻鏈接：https://www.youtube.com/watch?v=XmHDexCtjyw&list=PLjiXAZO27elC_xnk7gVNM85I2IQl5BEJ...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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正常安裝包報錯||[tcl] grab failed: window not viewable.
解決辦法： https://www.kimoton.com/entry/2018/04/10/134203
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【轉(zhuǎn)】基因組比對文件（SAM/BAM） Soft Clip 與 Hard ClipClip 的含義 Clip 作為名詞講，有剪下來的東西的意義角寸，在SAM/BAM 比對文件里面菩混，用于描述那些一條序列上，在序列兩端扁藕，比對不上的堿基序列（還是很形象的沮峡，一條上比對...
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基因在染色體上位置可視化感謝CJ大神的反復(fù)修改，這個功能越變越好了役耕！本文旨在復(fù)現(xiàn)CJ大神推文內(nèi)容采转，具體請參考“省心炸雞”，手動狗頭（http://www.reibang.com/p/b9034ce...
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服務(wù)器內(nèi)存UDIMM, RDIMM, LRDIMM, NVDIMM, DCPMM區(qū)別
近來需要在新采購的DELL R740XD服務(wù)器上增加內(nèi)存。在官方技術(shù)規(guī)格描述中故慈，R740XD一共支持4種不同類型的內(nèi)存：分別是RDIMM板熊，RDIMM， NVDIMM察绷， DCP...