日常瞎掰 ??一圖勝千言瞳遍，說明了其作為一種展現(xiàn)形式在呈現(xiàn)數(shù)據(jù)結(jié)果時(shí)的重要性舟山。雖說圖的本質(zhì)是用來展示結(jié)果障陶，其最主要的功能是以簡單的形式說明數(shù)據(jù)中蘊(yùn)含的意義，但有時(shí)候好看的外表也...
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R繪圖配色總結(jié) -
「用一個(gè)更復(fù)雜的例子脸候，來深入學(xué)習(xí)DESeq2差異表達(dá)分析后的小分析」這篇文章，對(duì)Griffith Lab[https://genviz.org/module-04-expression/0004/02/01/DifferentialExpre...
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使用HINT-ATAC進(jìn)行ATAC-Seq的footprinting分析關(guān)于ATAC-seq分析，在網(wǎng)上看到兩篇關(guān)于同一片綜述的翻譯飒硅，寫的很好：ATAC-seq數(shù)據(jù)分析工具的比較和推薦（Genome Biology綜述）ATAC-seq生信分析綜...
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使用ggplot2和ggrepel包做火山圖我是個(gè)R新手，只會(huì)簡單的畫一些圖作谚，還不能隨心所欲的畫圖三娩。Hadley Wickham男神的ggplot2包以及tidyverse超級(jí)大包真是讓人膜拜！最近實(shí)驗(yàn)室留學(xué)生讓我?guī)退?..
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UMAP圖上同時(shí)展示多個(gè)marker基因
最近有小伙伴問道一個(gè)問題妹懒，如何在一個(gè)單細(xì)胞UMAP/TSNE圖上展示多個(gè)marker基因的表達(dá)雀监，乍一看挺簡單的，后來也是思考了一些時(shí)間眨唬，慢慢解決了這個(gè)問題会前。 首先，Seura...
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轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究數(shù)據(jù)庫推薦 | 你要找的ChIP-seq數(shù)據(jù)都在這里啦匾竿！
染色質(zhì)免疫沉淀瓦宜、DNase-I超敏反應(yīng)和轉(zhuǎn)座酶可及性分析結(jié)合高通量測序，使染色質(zhì)動(dòng)力學(xué)岭妖、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和基因調(diào)控的全基因組研究成為可能歉提。 來自同濟(jì)大學(xué)的研究人員開發(fā)了人類和小鼠...
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什么時(shí)候使用Bismark的non_directional參數(shù)Bismark是做甲基化數(shù)據(jù)分析常用軟件笛坦，其中有一個(gè)--non_directional的參數(shù)，默認(rèn)是不啟用苔巨，如果需要時(shí)未啟用該參數(shù)版扩，會(huì)導(dǎo)致mapping rate下降近一半。...
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DNA甲基化Bismark侄泽、BSMAP流程跑起來日常掰蝦 ??前面學(xué)習(xí)了DNA甲基化的基礎(chǔ)知識(shí)礁芦，也了解了它的重要性，不知道的同學(xué)看這里悼尾，DNA甲基化知識(shí)概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
