240 發(fā)簡信
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    宏基因組shotgun入門筆記

    目錄 背景知識1.1. 根據(jù)分析對象的分類1.2. 三個基本數(shù)據(jù)處理問題1.3. 一般分析流程1.4. 比較宏基因組學(xué)的應(yīng)用1.5. 目前存在的技術(shù)問題實驗設(shè)計2.1. 幾點...

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    Mafft Trimal Fasttree建樹

    導(dǎo)讀 barrnap預(yù)測細菌基因組16S,獲取結(jié)果文件第二行最長16S云头,保留>1400bp的16S捐友。mafft做序列對齊。trimal修剪序列溃槐。fasttree建樹匣砖。ggtr...

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    生信常用文件格式

    2021.6.6 1. 序列格式 1.1 fasta 簡介一種基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式姻几。在這種格式中堿基對或氨基酸用單個字母來表示匣缘,且允許在序列前添加...

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