發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：福建
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8. GWAS：親緣關(guān)系——TASSEL&GCTA? 指在非家系群體或系譜不明確的群體中兩特定材料之間的遺傳相似度與任意材料之間的遺傳相似度的相對(duì)值； ? 材料間不平衡的血緣關(guān)系是導(dǎo)致標(biāo)記出現(xiàn)非連鎖相關(guān)的另一個(gè)重要原因肘迎，小家...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome wide association study，GWAS）是對(duì)多個(gè)個(gè)體在全基因組范圍的遺傳變異（標(biāo)記）多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)卧土，獲得基因型兜辞，進(jìn)而將基因型與可觀測(cè)的性狀，即表型夸溶，進(jìn)行群體水平的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，根據(jù)統(tǒng)計(jì)量或顯著性 p 值篩選出最有可能影響該性狀的遺傳變異（標(biāo)記）凶硅，挖掘與性狀變異相關(guān)的基因缝裁。
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程，并提供了基本的命令足绅，用到的軟件包括BWA捷绑、samtools、gatk氢妈、Plink粹污、Admixture、Tassel等首量，在此分享出來(lái)...
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單細(xì)胞基因可視化之UMAP圖修飾
更多精彩請(qǐng)至《KS科研分享與服務(wù)公眾號(hào)》除了之前說(shuō)過(guò)的三種常見(jiàn)單細(xì)胞基因可視化方法外加缘，還有一種最常用的就是直接在UMAP或者TSNE降維圖上顯示表達(dá)某基因的細(xì)胞鸭叙，這種方式更加...
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繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖嗡善，僅僅需要三列即可：a. 第...
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啊輝的科研
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基于的ssr 遺傳多樣性分析NOTE 基于種群聚類(lèi),特有等位基因 基本概念 1 多態(tài)性條帶 個(gè)人理解就是ssr引物1 在位點(diǎn) 擴(kuò)增出的 a b 2個(gè)條帶（2倍體）撩满，ab長(zhǎng)度可能相同也可能不相同蜒程。如果a條...
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一個(gè)分享生信知識(shí)的人
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目前做結(jié)構(gòu)變異伪嫁，歡迎交流
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Ubuntu網(wǎng)絡(luò)配置與SSH遠(yuǎn)程連接操作前需要以下軟件张咳，且帝洪，Ubuntu已經(jīng)安裝在VMware Workstation上。 VMware的編輯tab->虛擬網(wǎng)絡(luò)編輯 菜單查看網(wǎng)絡(luò)配置: 1.進(jìn)入su模式下脚猾，vi...
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