請(qǐng)問使用過(guò)FANTOM的cage庫(kù)嗎?
已發(fā)表的cage序列是哪個(gè)文件呢狐赡?
CAGE-seq[測(cè)序原理] CAGE-seq滋捶,加帽端mRNA測(cè)序痛悯,鑒定轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS) - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/5...
這是2007年的軟件,最近發(fā)表的rMATS用過(guò)嗎重窟?
二代轉(zhuǎn)錄組可變剪切(AS)分析1.背景知識(shí) 1.1什么是可變剪切 可變剪切(differential splicing)也叫做選擇性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前體到成...
最近在寫論文,這個(gè)問題記錄一下復(fù)制圖片進(jìn)WORD后刀闷,圖片顯示不出來(lái)_百度知道 (baidu.com)[https://zhidao.baidu.com/question/99...
為什么看很多要加 --chrom-map 和 chr-set
VCF 生成 plink 輸入文件(ped和map)使用工具 vcftools map文件 有四列筒扒,分別為 第一列:染色體編號(hào)為數(shù)字, 未知為0 第二列:SNP名稱為字符或數(shù)字, 如果不重要, 可以從1編號(hào), 注意要和ped文...
第二列:map狀態(tài)第五列:map評(píng)分怯邪,越高,對(duì)應(yīng)參考的位置越準(zhǔn)第六列:map情況 是M(match)還是I(insert)還是D(deletion)或者其他第七列:雙端測(cè)序的...
使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者對(duì)已有的工具進(jìn)行很好的分...
——by不是殺殺 雖然大多數(shù)時(shí)候在Windows下和在Jupyter中能夠非常方便快捷地進(jìn)行R語(yǔ)言編程祠肥,但對(duì)于處理數(shù)據(jù)量較大的工作時(shí)武氓,還是避免不了需要在服務(wù)器上運(yùn)行我們寫的代...
在看到一篇文章說(shuō)可以用bcftools來(lái)猜測(cè)樣本的性別,遂取查找相關(guān)的內(nèi)容,發(fā)現(xiàn)一個(gè)軟件可以來(lái)做, 從bam文件中檢測(cè)性別县恕,相關(guān)思路如下:1东羹、根據(jù)Y/X染色體的reads比,...
@Yvonne_eeb2 \t分隔忠烛,每行最后不要有空格
2022-06-08修改vcf文件樣本名稱属提,提取指定vcf樣本1.修改vcf樣本名 使用bcftools的 rehead指令 bcftools reheader -s sample.file old.vcf -o new.sample....
按照我給的list格式替換的嗎
2022-06-08修改vcf文件樣本名稱,提取指定vcf樣本1.修改vcf樣本名 使用bcftools的 rehead指令 bcftools reheader -s sample.file old.vcf -o new.sample....