重頭跟這里，沒有看見你什么建立group分組？怎么樣建立group分組贰谣，謝謝
跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(八):單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組差異基因分析及多組結(jié)果可視化接著單細(xì)胞下游分析： 從Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(一):開端Ｉ宋＞构帷迂曲！[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid...
IP屬地：福建
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@Danny_1f84 優(yōu)秀
TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析
TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡書 [htt...
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解決了嗎狸页？
TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析
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這代碼運(yùn)行報錯。
dataNorm <- TCGAanalyze_Normalization(tabDF = puried_data,
geneInfo = geneInfo,
method = "gcContent")
Step 1 of 4: newSeqExpressionSet ...
Step 2 of 4: withinLaneNormalization ...
Error in names(y) <- 1:length(y) :
'names'屬性的長度[2]必需和矢量的長度[0]一樣
如何解決扯再？求教芍耘，謝謝址遇。TCGA 01 TCGAbiolinks下載轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)差異分析
1. 準(zhǔn)備 安裝和導(dǎo)入TCGAbiolinks包 查看各個癌種的項目id，總共有65個ID值 查看project中有哪些數(shù)據(jù)類型齿穗，如查詢"TCGA-LUAD"傲隶，有7種數(shù)據(jù)類型...
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第九步：
dataNorm <- TCGAanalyze_Normalization(tabDF = puried_data,
geneInfo = geneInfo,
method = "gcContent")
I Need about 0 seconds for this Complete Normalization Upper Quantile [Processing 80k elements /s]
Step 1 of 4: newSeqExpressionSet ...
Step 2 of 4: withinLaneNormalization ...
Error in names(y) <- 1:length(y) :
'names'屬性的長度[2]必需和矢量的長度[0]一樣
如何解決？求教窃页，謝謝TCGAbiolinks全解析
部分一 第一步跺株、數(shù)據(jù)下載階段 第二步：GDCdownload()下載GDCquery()得到的結(jié)果 第三步、數(shù)據(jù)處理 第四步：TCGAanalyze_Preprocessin...
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GSEA分析fgsea包中，運(yùn)行cluster.genes<- markers %>% arrange(desc(avg_logFC)) %>% dplyr::select(genes,avg_logFC) #基因按logFC排序十籍，這個代碼 報錯
Error in `arrange()`:
! Problem with the implicit `transmute()` step.
x Problem while computing `..1 = avg_logFC`.
Caused by error:
! object 'avg_logFC' not found
Run `rlang::last_error()` to see where the error occurred.
是原因蛆封，怎么樣可以解決。謝謝單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組功能分析（超詳細(xì)clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）
單細(xì)胞分析不可避免的會涉及到鑒定不同細(xì)胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異勾栗，因此惨篱，功能分析在單細(xì)胞分析中相當(dāng)重要. 功能分析的方法很多，這兒我們主要講述3種功能分...
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單細(xì)胞之富集分析-3：GO和KEGG富集分析及繪圖單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：單細(xì)胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
