作者艾少，Evil Genius 我們來分享一下關于WES分析部分的內(nèi)容，其中內(nèi)容主要包括三部分 基礎部分翼悴，包括WES數(shù)據(jù)的call SNP、INDEL幔妨、MSI鹦赎、fusion、a...
IP屬地：福建
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外顯子（WES）panel分析基礎篇 -
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TWAS（fusion）最近在看遺傳數(shù)據(jù)與表達結合的東西傻谁，介紹一個經(jīng)典的方法吧孝治，fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
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2022《Cell》 作物馴化與育種中的整合基因組學導讀 野生植物被成功地馴化為農(nóng)作物是人類文明的大事件。該過程的成功很大程度上要歸功于持續(xù)的人工選擇态蒂。本文總結了過去十年在作物馴化和育種研究中的新發(fā)現(xiàn)杭措。作物基因組圖譜的構建和眾...
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bulk RNA-Seq （2）比對到參考基因組歡迎關注Bioinfor 生信云！ 上一篇推文講了bulk RNA-Seq 的數(shù)據(jù)清洗部分钾恢，接下來就是將清洗后的數(shù)據(jù)比對到參考基因組上（有參）手素。如果沒有參考基因組，那么就需要...
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群體進化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質(zhì)赘那，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成刑桑。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，是遺傳變異一個非常重要的來源募舟，...
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bcftools就可以祠斧，多此一舉
修改vcf文件中的樣本名稱
很多時候，call完變異后拱礁，需要對vcf文件中的樣本名進行修改琢锋，小編這里分享一個修改ID的python腳本(若vcf比較大，建議只對表頭進行修改呢灶，然后cat在一起)： 注：c...
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SNP calling及fst值的計算此處與云養(yǎng)江停的文章有略微差距 一.SNP calling 參照文章gvcf文件與vcf文件 - 簡書 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
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BSA分析-實戰(zhàn)筆記(四)下游分析參考文章：以水稻為例教你如何使用BSA方法進行遺傳定位（中篇）[http://www.reibang.com/p/9d842eac5c32] 一鲸阻、準備工作 需要安裝devt...
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Python | argparse
參考：博客園 | Python解析命令行讀取參數(shù) -- argparse模塊[https://www.cnblogs.com/arkenstone/p/6250782.htm...
