表達譜分析中闷串，經常會使用到相關性分析，探索一組基因間的共表達特征。例如准脂，這些基因間的表達是否存在較強的協同性，一個基因表達值的改變是否與另一個基因表達值改變顯著相關，它們之間...
IP屬地：廣東
-
基因表達相關性也可以用弦圖可視化（R語言） -
相關性分析的圖形在R中繪制
相關性分析的圖形繪制 相關性分析在我們做生信過程中用到的頻率很高。往往在別人的文章里看到這樣的圖岩饼。在自己找到hub基因中，進行相關性分析去看基因和基因的表達量之間是否有相關性...
-
推薦一個畫連鎖不平衡圖（LD block）的軟件LDBlockShow薛夜，親測比haploview好用籍茧！
最近需要畫LD block,之前一直用haploview軟件畫，haploview軟件毛病比較多梯澜，比如不能有多態(tài)位點寞冯，輸入的變異位點不能太多等。動不動就報錯晚伙。 最近試了一下另...
-
SNP x SNP 上位效應（epistasis）分析
傳統的全基因組關聯分析（GWAS）計算的是單個SNP與表型的相關性吮龄，除此之外，我們還可以進行SNP之間的互作效應與表型的相關性分析咆疗。 本推文主要介紹的是SNP間的上位效應與表...
-
Logistic回歸分析之二元Logistic回歸在研究X對于Y的影響時螟蝙，如果Y為定量數據，那么使用多元線性回歸分析（SPSSAU通用方法里面的線性回歸）民傻；如果Y為定類數據，那么使用Logistic回歸分析场斑。 結合實際情況漓踢，...
-
Primer Premier 5.0引物設計PCR引物設計⑴ 確定PCR產物片段大小（product length）漏隐；⑵ 確定引物所在區(qū)段喧半；⑶ 確定引物序列的長度范圍（primer length ）；⑷ 確定引物Tm值...
-
用NCBI查找已公布的引物序列青责，3秒鐘就能帶你完美找到~ZSCI 1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意：用此方法只建議進行 mRNA和lncRNA的基因表達引物查找挺据。 一取具、mRNA引物序列查找 步驟都在圖上...
-
科研干貨丨手把手教你做PCR引物設計！在整個PCR體系中扁耐，引物占有十分重要的地位暇检。PCR的特異性要求引物與靶DNA特異結合，不與其他非目的的DNA結合婉称，PCR的靈敏性要求DNA聚合酶能與引物進行有效的延伸块仆，可見引...
-
