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基因表達(dá)相關(guān)性也可以用弦圖可視化（R語(yǔ)言）表達(dá)譜分析中泵额，經(jīng)常會(huì)使用到相關(guān)性分析溯捆，探索一組基因間的共表達(dá)特征。例如，這些基因間的表達(dá)是否存在較強(qiáng)的協(xié)同性，一個(gè)基因表達(dá)值的改變是否與另一個(gè)基因表達(dá)值改變顯著相關(guān)廊谓，它們之間...
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生物學(xué)數(shù)據(jù)分析
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香港某大學(xué)在讀phd碟婆，記錄一些學(xué)習(xí)生信過(guò)程中筆記
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相關(guān)性分析的圖形在R中繪制
相關(guān)性分析的圖形繪制 相關(guān)性分析在我們做生信過(guò)程中用到的頻率很高。往往在別人的文章里看到這樣的圖惕稻。在自己找到hub基因中竖共，進(jìn)行相關(guān)性分析去看基因和基因的表達(dá)量之間是否有相關(guān)性...
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推薦一個(gè)畫連鎖不平衡圖（LD block）的軟件LDBlockShow腿准，親測(cè)比haploview好用际起！
最近需要畫LD block,之前一直用haploview軟件畫，haploview軟件毛病比較多吐葱，比如不能有多態(tài)位點(diǎn)街望，輸入的變異位點(diǎn)不能太多等。動(dòng)不動(dòng)就報(bào)錯(cuò)弟跑。 最近試了一下另...
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SNP x SNP 上位效應(yīng)（epistasis）分析
傳統(tǒng)的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）計(jì)算的是單個(gè)SNP與表型的相關(guān)性孟辑，除此之外哎甲，我們還可以進(jìn)行SNP之間的互作效應(yīng)與表型的相關(guān)性分析。 本推文主要介紹的是SNP間的上位效應(yīng)與表...
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Logistic回歸分析之二元Logistic回歸在研究X對(duì)于Y的影響時(shí)，如果Y為定量數(shù)據(jù)酝惧，那么使用多元線性回歸分析（SPSSAU通用方法里面的線性回歸）榴鼎；如果Y為定類數(shù)據(jù)，那么使用Logistic回歸分析晚唇。 結(jié)合實(shí)際情況巫财，...
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Primer Premier 5.0引物設(shè)計(jì)PCR引物設(shè)計(jì)⑴ 確定PCR產(chǎn)物片段大小（product length）哩陕；⑵ 確定引物所在區(qū)段平项；⑶ 確定引物序列的長(zhǎng)度范圍（primer length ）；⑷ 確定引物Tm值...
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用NCBI查找已公布的引物序列，3秒鐘就能帶你完美找到~ZSCI 1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意：用此方法只建議進(jìn)行 mRNA和lncRNA的基因表達(dá)引物查找心赶。 一扣讼、mRNA引物序列查找 步驟都在圖上...
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科研干貨丨手把手教你做PCR引物設(shè)計(jì)椭符！在整個(gè)PCR體系中荔燎，引物占有十分重要的地位。PCR的特異性要求引物與靶DNA特異結(jié)合销钝，不與其他非目的的DNA結(jié)合有咨，PCR的靈敏性要求DNA聚合酶能與引物進(jìn)行有效的延伸，可見引...
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引物設(shè)計(jì)引物設(shè)計(jì)——QPCR 一、序列查找 參考漢恒生物技術(shù)文檔 常用數(shù)據(jù)庫(kù) NCBI-GeneBank Nucleotide Gene NCBI不多做介紹纵装。NC表示人類基因組DNA...
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2020-12-06 引物設(shè)計(jì)--小結(jié)
引物設(shè)計(jì)原則 一征讲、Tm值 sense primer和anti-senseprimerTm溫差最好不超過(guò)2度。 二橡娄、GC% GC含量 對(duì)于PCR反應(yīng)來(lái)說(shuō)GC含量在40%—60%...
