中科院碩博生一枚，用簡書來記錄自己精讀paper和學(xué)習(xí)生信的過程辙浑。
發(fā)簡信
IP屬地：山西
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10× Genomics單細(xì)胞免疫組庫VDJ分析必知必會(huì)我們生活著的世界并非只有我們自己判呕，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著昔期，有的讓我們開心，有的使我們傷心佛玄。這就關(guān)系到一個(gè)本質(zhì)的問題： 我是誰？ 我是一個(gè)腦袋累澡，一個(gè)軀體...
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冰凍切片中部分問題總結(jié)
一、樣品處理 1.1 Q：包埋過程應(yīng)遵從什么原則蕊梧？A： (1) 選取的組織要大小合適霞赫，便于后續(xù)實(shí)驗(yàn)操作。 (2) 取的組織要盡量新鮮肥矢，避免RNA降解端衰。 (3) 選用合適的包埋...
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跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(四):單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序UMAP降維聚類
更多內(nèi)容請關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)---KS科研分享與服務(wù)---接上節(jié)（跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(三):單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)控（QC）及合并去除批次效應(yīng)[http://mp.wei...
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性豁達(dá)旅东，擅言談灭抑，闊家子也
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StringTie + DESeq2 進(jìn)行 RNA-seq 差異基因分析按：RNA-seq 流程非常多樣化，每一個(gè)步驟可選工具都非常多抵代。我的選擇是 StringTie 進(jìn)行組裝取得 read counts 數(shù)值腾节，DESeq2 分析差異基因。這里把...
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生信工作者。
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Bulk RNA-Seq 差異表達(dá)分析流程以前寫過不少零散的 RNA-Seq 分析文章康吵，現(xiàn)在整理為流程劈榨，同時(shí)修改一些錯(cuò)誤。流程包含質(zhì)控涎才、比對(duì)鞋既、定量、差異分析耍铜。 前處理 拿到原始 fastq 數(shù)據(jù)先進(jìn)行前處理邑闺。前處理包...
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生信狗一枚伴挚，致力于轉(zhuǎn)錄組靶衍，全基因組，全外顯子茎芋，CHIP-seq颅眶，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞ATAC數(shù)據(jù)分析，歡迎關(guān)注交流田弥！<br><br>??????關(guān)注公眾號(hào)涛酗！
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懦夫把困難舉在頭頂商叹，英雄把困難踩在腳下
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公眾號(hào) 生信小課堂
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『鵝廠號(hào): 生信云筆記』分享生信分析及數(shù)據(jù)可視化相關(guān)的內(nèi)容请唱，歡迎關(guān)注和交流弥咪！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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為什么要以數(shù)據(jù)庫的思維來理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)在我們涉足單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析不久之后就會(huì)發(fā)現(xiàn)，我們在和一套新的理念打交道晚岭。在這套理念中鸥印，對(duì)象是常見的，數(shù)據(jù)是多維的坦报，往往是一張核心表及其附屬库说。我們對(duì)一張表是熟悉的，Excel極大...
