發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江西
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互幫互助問答帖
雖然沒有幾個(gè)關(guān)注，但能看到這些筆記的應(yīng)該都是同志們 有時(shí)候朋友的私信我可能看不到瞬逊，我也不一定能解決显歧。 群體遺傳學(xué)方面、生信方面确镊、R語(yǔ)言等等士骤，如果...
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跟 Susan R. McCouch 學(xué)習(xí)單基因的進(jìn)化分析基于 Susan R. McCouch 同期的兩篇文獻(xiàn)學(xué)習(xí)一下單基因的進(jìn)化分析，一篇是發(fā)表在 PNAS 上關(guān)于水稻香味基因 BADH2 的分析蕾域，...
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基于 GetOrganelle 組裝葉綠體基因組
GetOrganelle是一款由中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所的金建軍和郁文彬兩位老師共同開發(fā)的質(zhì)體組裝軟件拷肌，主要用于從基因組測(cè)序數(shù)據(jù)中組裝完整的細(xì)胞...
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samtools 一些使用命令
對(duì) SAM 或 BAM 格式的文件進(jìn)行快速的統(tǒng)計(jì)分析： samtools flagstat xx.bam 示例： 415088184 + 0 i...
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LTR finder 和 LTR_retriever 使用說(shuō)明
LTRfinder是一個(gè)用于識(shí)別和分析基因組中長(zhǎng)末端重復(fù)序列（Long Terminal Repeat, LTR）的工具。LTR是一種在許多真核...
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DFOIL 檢驗(yàn)
DFOIL 檢驗(yàn)是一種用于確定基因流方向的統(tǒng)計(jì)方法旨巷，它基于五群體系統(tǒng)發(fā)育樹的分析巨缘。DFOIL檢驗(yàn)是 ABBA-BABA 檢驗(yàn)的擴(kuò)展，它通過考慮更...
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ABBA-BABA 檢驗(yàn)
ABBA-BABA檢驗(yàn)是一種用于識(shí)別基因流的方法采呐，它基于四群體模型若锁，其中包括兩個(gè)與第三個(gè)群體（P3）密切相關(guān)的群體（P1和P2），以及一個(gè)外群（...
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awk 從一串字符中提取特定部分
Parent=Os01t0115700-00 從這個(gè)字符中提取 Os01t0115700 echo "Parent=Os01t01...
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基于 RepeatModeler 預(yù)測(cè)基因組的重復(fù)序列重復(fù)序列在基因組中廣泛存在懈万，包括轉(zhuǎn)座子拴清、簡(jiǎn)單重復(fù)序列和低復(fù)雜度區(qū)域等。這些重復(fù)序列對(duì)于基因組結(jié)構(gòu)会通、功能和進(jìn)化具有重要影響口予。RepeatModel...