原文：信號(hào)通路研究思路_百度文庫(kù) https://wenku.baidu.com/view/449d5a41ec3a87c24128c450 證明一個(gè)藥物能通過(guò)抑制P38表...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：甘肅
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信號(hào)通路研究思路
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單細(xì)胞文獻(xiàn)12- 持續(xù)感染 SARS-CoV-2 的 COVID-19 患者的臨床和分子特征Clinical and molecular characteristics of COVID-19 patients with persistent SARS-CoV-2 ...
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搬磚的工人<br>
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單細(xì)胞測(cè)序?qū)W習(xí)
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不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書(shū)鎖了
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)008--[sc]兩篇PBMC單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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中科院研究生在讀酗洒，努力學(xué)習(xí)中
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基于R語(yǔ)言繪制坐標(biāo)軸截?cái)鄨D畫(huà)圖時(shí)經(jīng)常遇到不同組的數(shù)據(jù)大小相差很大，大數(shù)據(jù)就會(huì)掩蓋小數(shù)據(jù)的變化規(guī)律枷遂，這時(shí)候可以對(duì)Y軸進(jìn)行截?cái)嘤Ｖ裕瑥亩梢栽诓煌瑢用妫ù髷?shù)據(jù)和小數(shù)據(jù)層面）全面反映數(shù)據(jù)變化情況，如下圖所示登淘。 ...
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R小tip(五）截?cái)嘧鴺?biāo)軸畫(huà)法前言 轉(zhuǎn)載自：http://www.reibang.com/p/de283990ecd1[http://www.reibang.com/p/de283990ecd1]以獲...
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R | 卡方檢驗(yàn)
χ2檢驗(yàn)主要有三個(gè)用途：?jiǎn)螛颖痉讲畹耐|(zhì)性檢驗(yàn)、獨(dú)立性檢驗(yàn)和適合性檢驗(yàn)封字。適合性檢驗(yàn)和獨(dú)立性檢驗(yàn)都是應(yīng)用于離散型資料的假設(shè)檢驗(yàn)黔州，其基本原理是通過(guò)χ2值的大小來(lái)檢驗(yàn)觀測(cè)值（obs...
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limma的兩個(gè)弟弟：edgeR和DESeq201—研究背景 上一篇公眾號(hào)我們?yōu)榇蠹以敿?xì)的介紹了R軟件包limma篩選差異基因耍鬓，limma包做差異分析要求數(shù)據(jù)滿足正態(tài)分布或近似正態(tài)分布，如基因芯片流妻、TPM格式的高通量測(cè)序...
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pheatmap熱圖技巧合集突然間發(fā)現(xiàn)牲蜀，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個(gè)選項(xiàng)了。是時(shí)候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個(gè)值得注意的參數(shù)绅这，它旨在說(shuō)明你想...
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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簡(jiǎn)單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM涣达？
劉小澤寫(xiě)于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM证薇。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性度苔，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
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批次效應(yīng)及多數(shù)據(jù)集合并
如何判斷有批次效應(yīng) 數(shù)據(jù)集中明確說(shuō)明 Boxplot圖 聚類樹(shù) PCA分析 芯片數(shù)據(jù)的處理 1.批次效應(yīng)不能被消除浑度，只有盡可能的降低寇窑。2.是否會(huì)矯枉過(guò)正？① 聯(lián)合分析正常組為...
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循環(huán)函數(shù)的基本類型for 和 while
1. for循環(huán) for (var in seq) expr var表示循環(huán)變量seq為向量箩张，限定了循環(huán)變量的取值范圍和循環(huán)次數(shù)expr為執(zhí)行的語(yǔ)句（按照seq的順序依次執(zhí)行...
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個(gè)人向ggplot2箱線圖總結(jié)主要從如何看圖甩骏、用圖與作圖三個(gè)方面來(lái)對(duì)箱線圖進(jìn)行理解和總結(jié)。 1先慷、看圖 如圖所示饮笛，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進(jìn)行繪制的，包含6個(gè)數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)论熙，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣福青、上...
