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在做單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候,獲得分群后我們希望知道每個(gè)群的marker基因是什么以此來描述細(xì)胞群的特征钧唐。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本(高変基因)或者每個(gè)亞群(差異基...
一挑随、前言 1.1 概念 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用來描述不同樣品之間基因關(guān)聯(lián)模式...
本期內(nèi)容為[跟著NC學(xué)作圖]--箱線圖(一個(gè)函數(shù)獲得Mean状您、SD、P值)-- 箱線圖我們在以前的教程中分享過兜挨,但是計(jì)算P值和差異性感覺還是比較復(fù)雜的膏孟。我們今天看看發(fā)表在NC...
有小伙伴在群里咨詢了一個(gè)圖的做法,如下: (Reference:GRB10 and E2F3 as Diagnostic Markers of Osteoarthritis ...
前面小編給大家講解過 ?R計(jì)算多個(gè)向量兩兩之間相關(guān)性[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...
目前R中繪制熱圖的方式有很多拌汇,常用的如pheatmap骆莹、ComplexHeatmap包等,這里再給大家介紹一個(gè)輕量級的R包-HeatmapR包担猛,即無需過多的前期數(shù)據(jù)處理幕垦,可同...
導(dǎo)讀 前面我們已經(jīng)整合了高質(zhì)量的細(xì)胞,現(xiàn)在我們想知道細(xì)胞群中存在的不同細(xì)胞類型 傅联,因此下面將進(jìn)行細(xì)胞聚類分析先改。 學(xué)習(xí)目標(biāo) 描述評估用于聚類的主成分?jǐn)?shù)量的方法 根據(jù)重要的主成分...
啞鈴圖比驻,又叫做棒棒糖圖该溯。因其形狀和棒棒糖相似而得名,具體來看實(shí)際上是一個(gè)散點(diǎn)和一條線段的組合别惦。棒棒糖圖是散點(diǎn)圖的一種變體狈茉,又與柱狀圖非常相似,但其在清晰展示數(shù)據(jù)的同時(shí)掸掸,減少了...
生信分析請關(guān)注生信小課堂蹭秋,全網(wǎng)同名 影響因子:15.266 研究背景: 免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICI)開創(chuàng)了癌癥治療的新時(shí)代,然而堤撵,只有相對較小比例的患者對其有反應(yīng)仁讨,凸顯生物標(biāo)志...
本研究使用了EC特異性多光譜譜系追蹤小鼠(Pdgfb-iCreERT2-R26R-Brainbow2.1)結(jié)合單細(xì)胞RNA測序,共同研究了介導(dǎo)成年小鼠心臟新生血管生成的EC的...
Review of Single-Cell RNA Sequencing in the Heart 導(dǎo)讀:單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)技術(shù)是一種強(qiáng)大的实昨,快速發(fā)展的工...
摘要 哺乳動(dòng)物心臟中非心肌細(xì)胞(包括內(nèi)皮細(xì)胞洞豁、成纖維細(xì)胞、周皮細(xì)胞和免疫細(xì)胞)在單細(xì)胞水平上的細(xì)胞特性和分子特征目前仍不明確荒给。使用最新的單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)來描繪非心肌細(xì)胞轉(zhuǎn)錄特...
##Single-Cell Sequencing of the Healthy and Diseased Heart Reveals Cytoskeleton Associa...