240 發(fā)簡信
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    VCF格式

    劉小澤寫于18.7.17所有的數(shù)據(jù)，一旦要找變異位點信息弦追，就離不開VCF岳链。豆豆也是在寫一個重測序的操作流程，遇到了VCF文本劲件，之前也是沒有了解過掸哑，這次再多學一個格式官方最新說...

  • GATK4 多個樣本GenotypeGVCFs前用 CombineGVCFs還是GenomicsDBImport

    我們知道，GATK 4 多個樣本joint genotyping用模塊GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三種形式的輸入文件：1）a sin...

  • NGS數(shù)據(jù)下載

    本來想重復冷泉港Lippman 2017年在Cell上的一篇文章：Bypassing Negative Epistasis on Yield in Tomato Impose...

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    3. SNP Calling

    以GATK流程為例牵辣，簡單來說摔癣，SNP Calling主要包括以下幾步： 1. 給參考基因組建立索引：samtools faidx、bwa index, gatk Create...

  • 如何成為有效學習的高手

    最近在得到聽了這篇文章，感覺比較有用危彩，會隨聽隨更新攒磨。 Day 1：高效學習的定義泳桦。 高效學習汤徽，即找到最適合自己的學習手法，在相對短的時間內(nèi)集中注意力灸撰，以解決一個工作和生活當中...

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    2. BSA的原理

    BSA（Bulked Segregant Analysis）泰鸡，集群分離分析或分離群體分組分析法。兩個特點：1. 混池2. 性狀分離所以壳鹤，BSA可以稱之為分析有性狀分離的群體分...

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    1. 熱身（案例及實驗設(shè)計）

    什么是BSA-seq BSA（Bulked Sergeant Analysis）余舶，即分離體分組混合分析法，也稱為集群分離分析法或混合分組分析法锹淌，是從近等基因系分析法演變而來的...

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