trim_galore要運(yùn)行多久啊，我的運(yùn)行了一下午了還沒(méi)有g(shù)z文件
Trim Galore ——自動(dòng)檢測(cè)adapter的質(zhì)控軟件之前分析過(guò)的測(cè)序數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)質(zhì)量都很好唠椭，給了我一個(gè)錯(cuò)覺(jué)質(zhì)控的前后差別不是很大帜消，內(nèi)心里對(duì)質(zhì)控這一步也就不是很重視赋访，跑完質(zhì)控有時(shí)也懶得看結(jié)果挠将，拿到一批測(cè)序數(shù)據(jù)后忘渔，也總是忽略了去看測(cè)...
對(duì)于不同數(shù)據(jù)集合的比較的可視化产弹，一般用韋恩圖來(lái)表示，但是數(shù)據(jù)集合太多了弯囊，就不好看了痰哨，反而不容易從圖中獲得信息了。 三個(gè)集合看起來(lái)最合適匾嘱。 2012年發(fā)表的香蕉基因組文章中的韋...
分析基因表達(dá)量和預(yù)后的關(guān)系大體思路為：找出某一癌癥中感興趣的基因表達(dá)量和病人生存時(shí)間的數(shù)據(jù)斤斧，再進(jìn)行生存分析，畫(huà)圖 分解起來(lái)看 第一步：得到基因表達(dá)量和病人生存時(shí)間相應(yīng)的數(shù)據(jù) ...
一.對(duì)于TXT文件 1.對(duì)于簡(jiǎn)單文件霎烙，可以簡(jiǎn)單讀取撬讽，ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.對(duì)于復(fù)雜文件，ex1 <-read.table("文件名如e...
PCA（Principal Component Analysis）主成分分析悬垃， 用來(lái)考察多個(gè)變量間相關(guān)性一種多元統(tǒng)計(jì)方法游昼，研究如何通過(guò)少數(shù)幾個(gè)主成分來(lái)揭示多個(gè)變量間的內(nèi)部結(jié)構(gòu)...
熱圖（Heatmap）：用顏色變化直觀的表達(dá)數(shù)據(jù)之間差異的圖罐寨，是對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)制和差異數(shù)據(jù)的展現(xiàn)，是數(shù)據(jù)挖掘類(lèi)文章的標(biāo)配序矩。 例如上圖鸯绿，每個(gè)小方格表示每個(gè)基因，其顏色表示該基...
一. 讀取數(shù)據(jù) 因?yàn)槲覀円话阕约轰浀臄?shù)據(jù)都是excel表格的租幕，對(duì)于讀取excel舷手，此處有一個(gè)小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
生物信息學(xué)分析和作圖是科研狗們的必備技能。近幾年歉眷，隨著數(shù)據(jù)類(lèi)型的增多牺六，excel、SPSS等常用軟件已經(jīng)不能滿足科研需求了汗捡。R語(yǔ)言以其方便淑际、快捷的優(yōu)勢(shì)，迅速獲得許多編程技術(shù)不...
