trim_galore要運行多久啊番舆，我的運行了一下午了還沒有g(shù)z文件
Trim Galore ——自動檢測adapter的質(zhì)控軟件之前分析過的測序數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)質(zhì)量都很好，給了我一個錯覺質(zhì)控的前后差別不是很大，內(nèi)心里對質(zhì)控這一步也就不是很重視，跑完質(zhì)控有時也懶得看結(jié)果，拿到一批測序數(shù)據(jù)后，也總是忽略了去看測...
對于不同數(shù)據(jù)集合的比較的可視化陨界，一般用韋恩圖來表示巡揍，但是數(shù)據(jù)集合太多了，就不好看了菌瘪，反而不容易從圖中獲得信息了腮敌。 三個集合看起來最合適。 2012年發(fā)表的香蕉基因組文章中的韋...
分析基因表達量和預(yù)后的關(guān)系大體思路為：找出某一癌癥中感興趣的基因表達量和病人生存時間的數(shù)據(jù)俏扩，再進行生存分析糜工，畫圖 分解起來看 第一步：得到基因表達量和病人生存時間相應(yīng)的數(shù)據(jù) ...
一.對于TXT文件 1.對于簡單文件，可以簡單讀取录淡，ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.對于復雜文件捌木，ex1 <-read.table("文件名如e...
PCA（Principal Component Analysis）主成分分析， 用來考察多個變量間相關(guān)性一種多元統(tǒng)計方法嫉戚，研究如何通過少數(shù)幾個主成分來揭示多個變量間的內(nèi)部結(jié)構(gòu)...
熱圖（Heatmap）：用顏色變化直觀的表達數(shù)據(jù)之間差異的圖，是對實驗數(shù)據(jù)進行質(zhì)制和差異數(shù)據(jù)的展現(xiàn)慈俯，是數(shù)據(jù)挖掘類文章的標配。 例如上圖拥峦，每個小方格表示每個基因贴膘，其顏色表示該基...
一. 讀取數(shù)據(jù) 因為我們一般自己錄的數(shù)據(jù)都是excel表格的，對于讀取excel玄柠，此處有一個小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
生物信息學分析和作圖是科研狗們的必備技能。近幾年这弧，隨著數(shù)據(jù)類型的增多娃闲，excel、SPSS等常用軟件已經(jīng)不能滿足科研需求了匾浪。R語言以其方便皇帮、快捷的優(yōu)勢，迅速獲得許多編程技術(shù)不...
