4.字符串 4.1 轉(zhuǎn)義字符 4.2 字符串格式化 4.2.1 百分號(hào)（%） 4.2.2 元組的字符串格式化 占位符個(gè)數(shù)和元組個(gè)數(shù)要相等； 若使用列表代替元組珠移，列表僅代表一個(gè)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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4.python字符串
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3.python元組
3.元組 Python的元組與列表類(lèi)似陕习，不同之處在于元組的元素不能修改（前面多次提到的字符串也是不能修改的）。創(chuàng)建元組的方法很簡(jiǎn)單：如果你使用逗號(hào)分隔了一些值骗奖，就會(huì)自動(dòng)創(chuàng)建元...
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2.python列表
2. 列表 不同于元組和字符串，列表的內(nèi)容是可變的（mutable）。 2.1 更新列表 2.1.1 元素賦值 ①簡(jiǎn)單賦值（同R） ②報(bào)錯(cuò)情況（R可以） 不能為一個(gè)不存在元素...
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1.python序列
1.通用序列操作（P48） 1.1 索引（正數(shù)索引同R向量惰聂，負(fù)數(shù)索引R為刪除） 1.2 分片 1.2.1 定義student 1.2.2 正數(shù)分片（同R） 1.2.3 負(fù)數(shù)分...
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請(qǐng)問(wèn)樣本整合之前需要先過(guò)濾細(xì)胞嗎
Seurat的三種單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合方法匯總（批次校正）2022-05-24
關(guān)鍵詞 批次效應(yīng) 批次校正 單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合 適用背景 單細(xì)胞數(shù)據(jù)由于實(shí)驗(yàn)平臺(tái)或樣本等原因會(huì)造成不同數(shù)據(jù)集之間存在批次效應(yīng)，這種批次效應(yīng)是人為因素造成的咱筛，沒(méi)有實(shí)際的生物學(xué)意義搓幌，...
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請(qǐng)問(wèn)整合之前為啥不先過(guò)濾細(xì)胞
seurat單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組整合分析教程-01
前段時(shí)間跟師兄聊天，聊到seurat包迅箩，他說(shuō)學(xué)軟件一定要知道這個(gè)軟件開(kāi)發(fā)的目的溉愁，它是要解決哪些主要問(wèn)題，哪些是次要問(wèn)題饲趋，次要問(wèn)題其他R包同樣解決拐揭，他開(kāi)發(fā)的主線(xiàn)是什么。單細(xì)胞多...
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您好奕塑，請(qǐng)問(wèn)多個(gè)樣本整合之前需要先過(guò)濾細(xì)胞嗎
10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）整合分析之nature文獻(xiàn)思路整理
hello堂污，大家好，今天來(lái)分享一篇nature文獻(xiàn)的10X單細(xì)胞樣本整合分析的方法龄砰，關(guān)于多樣本整合分析盟猖，之前我的公開(kāi)課和宣講課講了很多讨衣，聽(tīng)過(guò)的都應(yīng)該有一些整合的思路，今天我們...
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您好式镐，整合之前不需要先對(duì)細(xì)胞進(jìn)行過(guò)濾嗎
單細(xì)胞多樣本整合分析
代碼主要來(lái)自：https://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction.html[https://sati...
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答疑| ggplot 繪制火山圖并添加文字標(biāo)簽
答疑|火山圖加文字標(biāo)簽 后臺(tái)有幾個(gè)同學(xué)對(duì)之前的教程跟著CELL學(xué)作圖|1.火山圖[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIxMDExNDE0OQ...
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白話(huà)“卡方檢驗(yàn)”白話(huà)“卡方檢驗(yàn)” 什么是“卡方檢驗(yàn)”反镇？ 卡方檢驗(yàn)是假設(shè)檢驗(yàn)的一種，用于分析兩個(gè)類(lèi)別變量的相關(guān)關(guān)系娘汞，是一種非參數(shù)假設(shè)檢驗(yàn)歹茶，得出的結(jié)論無(wú)非就是“兩個(gè)變量相關(guān)”或者“兩個(gè)變量”不相...
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方差分析、T檢驗(yàn)价说、卡方分析如何區(qū)分辆亏？差異研究的目的在于比較兩組數(shù)據(jù)或多組數(shù)據(jù)之間的差異，通常包括以下幾類(lèi)分析方法鳖目，分別是方差分析扮叨、T檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)。 三個(gè)方法的區(qū)別 其實(shí)核心的區(qū)別在于：數(shù)據(jù)類(lèi)型不一樣领迈。如果是定...
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使用R語(yǔ)言進(jìn)行卡方檢驗(yàn)（chi-square test）文|程瑞林（山東大學(xué)第二醫(yī)院足踝外科）來(lái)源|（微信公眾號(hào)）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟導(dǎo)讀：對(duì)于計(jì)量資料彻磁，臨床醫(yī)學(xué)研究中常用的統(tǒng)計(jì)分析方法是t檢驗(yàn)；而對(duì)于計(jì)數(shù)資...
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用R語(yǔ)言進(jìn)行相關(guān)性分析：畫(huà)出散點(diǎn)圖狸捅、擬合線(xiàn)及標(biāo)注相關(guān)系數(shù)和P值一. 讀取數(shù)據(jù) 因?yàn)槲覀円话阕约轰浀臄?shù)據(jù)都是excel表格的衷蜓，對(duì)于讀取excel，此處有一個(gè)小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
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堆疊柱狀圖各成分連線(xiàn)畫(huà)圖的R腳本18年1月29日宏基因組轉(zhuǎn)載了中科院生態(tài)中心鄧曄組的文章《土壤細(xì)菌定量方法結(jié)合相對(duì)豐度分析揭示種群的真實(shí)變化》[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
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微生物多樣研究—差異分析1. 隨機(jī)森林模型 隨機(jī)森林是一種基于決策樹(shù)（Decisiontree）的高效的機(jī)器學(xué)習(xí)算法尘喝，可以用于對(duì)樣本進(jìn)行分類(lèi)（Classification）磁浇，也可以用于回歸分析（Re...
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微生物多樣研究—微生物深度分析概述
一、微生物深度分析方法核心思想 復(fù)雜微生物群落解構(gòu)的核心思想： 不預(yù)設(shè)任何假定朽褪，客觀地觀測(cè)整個(gè)微生物組所發(fā)生的一系列結(jié)構(gòu)性變化特征置吓，最終識(shí)別出與疾病或所關(guān)注的表型相關(guān)的關(guān)鍵微...
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微生物-環(huán)境因子
目錄 VIF方差膨脹因子分析 RDA/CCA分析 db-RDA分析 Mantel Test分析 相關(guān)性Heatmap圖 環(huán)境因子排序回歸分析 VPA方差分解分析 MaAsli...
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Pilon | 基因組糾錯(cuò)
前言 三代測(cè)序錯(cuò)誤率比較高，一般組裝后需要進(jìn)行糾錯(cuò)來(lái)提高準(zhǔn)確度缔赠。本次介紹使用Pilon通過(guò)引入二代測(cè)序數(shù)據(jù)來(lái)對(duì)三代基因組進(jìn)行糾錯(cuò)衍锚。 Pilon官網(wǎng) Pilon軟件安裝 Pil...
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RNAseq 必讀綜述和在線(xiàn)教程最近讀到一篇博文，介紹了學(xué)習(xí) RNAseq 數(shù)據(jù)分析非常推薦的兩篇綜述和七個(gè)在線(xiàn)教程并發(fā)表了相關(guān)評(píng)論嗤堰。本文將進(jìn)行簡(jiǎn)要整理并對(duì)相關(guān)評(píng)論內(nèi)容進(jìn)行大致翻譯戴质，供國(guó)內(nèi)讀者參考。 兩篇綜...