請問為什么cDNA正反鏈都能結合呢返十？由于flowcell的P5和P7都是5‘ end， 當P5/P7其中一條和cDNA的P5/P7是互補配對椭微，另一條是序列相同洞坑，才能進行橋式PCR，所以不應該只有cDNA其中一條鏈才能結合到flow cell嗎蝇率？
你真的搞懂測序技術了嗎——第二代測序本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號迟杂，轉載請注明出處 之前我們講了測序以及第一代測序技術，還沒看的小伙伴可以先去補補課（你真的搞懂測序技術了嗎——測序本慕、第一代測序[https://w...
請問博主排拷，flowcell的P7和cDNA上P7是一個序列，而P5和cDNA的P5是互補的锅尘？所以只有3’ end的P5才會被flow cell捕獲监氢？
總的來說：flow cell P5和P7都是5‘ end，只有P5和cDNA的3’ P5互補鉴象，所以才被捕獲忙菠？
你真的搞懂測序技術了嗎——第二代測序本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號，轉載請注明出處 之前我們講了測序以及第一代測序技術纺弊，還沒看的小伙伴可以先去補補課（你真的搞懂測序技術了嗎——測序牛欢、第一代測序[https://w...
本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號，轉載請注明出處 之前我們講了測序以及第一代測序技術淆游，還沒看的小伙伴可以先去補補課（你真的搞懂測序技術了嗎——測序傍睹、第一代測序[https://w...
練習數(shù)據(jù)集的GEO編號：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
snakemake是一個用來編寫任務流程的工具访得，用python編寫的龙亲，因此其執(zhí)行的流程腳本也比較通俗易懂，易于理解悍抑。 一鳄炉、從一個簡單的例子開始 1、安裝snakemake 安...
比對結束后搜骡，需要了解比對結果的情況拂盯，可以采用samtools flagstat進行統(tǒng)計samtools flagstat統(tǒng)計bam文件比對后每一個參數(shù)的解釋如下： 如果有些結...
一、先決條件 安裝Python插件记靡。 安裝Python 3的一個版本谈竿，有幾種途徑： Linux上的內置Python安裝。 MacOS上使用brew安裝摸吠。brew instal...
參考資料：http://starsyi.github.io/2016/05/24/SAM%E6%96%87%E4%BB%B6%E6%A0%BC%E5%BC%8F%E8%AF%...
0.安裝R包 1.下載數(shù)據(jù)，提取表達矩陣和臨床信息 檢查數(shù)據(jù)下載的完整性看兩個KB或MB大小是否一樣 2.分組信息&探針注釋 當一列中一部分相同轿腺，一部分不相同，取不同部分時 ...
作者：白介素2 這一節(jié)的內容包括應用 GEOquery包下載芯片數(shù)據(jù)丛楚，提取表達矩陣族壳，提取metadata信息。解決一個探針對應多個基因的問題 GEO數(shù)據(jù)下載-GEOquery...
這里分析小練習來自生信星球（一個很好的生信學習平臺）仿荆，有蠻多值得學習的知識點，一起來學習吧~ 假設數(shù)據(jù)：兩組實驗對象坏平，各三個重復樣本拢操。進行轉錄組分析之類的之后，結果得到10個...
書接第二回TCGA-2.GDC數(shù)據(jù)整理舶替，留下了一個大坑令境，GDC下載的數(shù)據(jù)整理出來表達矩陣是缺少行名的。 手癢的我要動手了顾瞪。 加行名并不容易舔庶，我搗鼓了好久啊抛蚁。 思路 1.表達矩...
僅針對人類而言瞧甩。雖然一直對GO和KEGG不感冒，但流程化的分析還是要做的弥鹦。主要包括兩部分： 將基因編號轉為ENTREZID(具有唯一性）：基因編號來自ANNOVAR的注釋結果...
