微信公眾號：R語言和Python學(xué)堂
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DESeq2差異分析十全大補(bǔ)使用筆記寫在前面：新手老菜鳥陋率，個人心得颂鸿，不足之處歡迎交流指正吗冤；寫作不易便贵，轉(zhuǎn)載前請聯(lián)系我征得同意问顷，謝謝昂秃。 1.基本原理 1.1 概述 全稱：DESeq2 package for dif...
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（四）：差異分析前的準(zhǔn)備——數(shù)據(jù)檢查本節(jié)概覽：數(shù)據(jù)預(yù)處理, 進(jìn)行樣本間具有可比性boxplot查看樣本的基因整體表達(dá)情況查看不同分組的聚類情況：樣本hclust 圖蚀腿、距離熱圖、PCA圖扫外、差異基因熱圖莉钙、相關(guān)性熱圖...
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R可視化之ComplexHeatmap【二】：行（列）順序、行（列）名特別聲明：本部分（系列）內(nèi)容均來自顧祖光博士對ComplexHeatmap的介紹筛谚，僅為學(xué)習(xí)交流磁玉，尊重原創(chuàng)。 熱圖系列我們已經(jīng)有： R可視化之ComplexHeatmap【一】...
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手，打工人谓晌，搬運(yùn)工掠拳。<br>像王子文一樣財(cái)務(wù)自由，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致扎谎，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
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富集分析GO碳想，KEGG烧董，DO等市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上；...
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）轉(zhuǎn)換為gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol----前不久拿到公司給的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果胧奔，Gene ID是以ENMUST開頭逊移，查了一下，ENST為EMBL 核酸數(shù)據(jù)庫中人類的轉(zhuǎn)錄本ID龙填，ENMUST為鼠的轉(zhuǎn)錄本ID胳泉。一般我...
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學(xué)生信的那些事兒之二 - （小白）怎么學(xué)生信
只有當(dāng)一個人對自己失去信心的那一刻控汉，他才是真的過時(shí)了》滴牵——《飛馳人生》 什么是生物信息學(xué) 生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集姑子、處理、存儲测僵、傳播街佑，分...
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【康華同學(xué)】:優(yōu)秀生物信息學(xué)博客 專注收集優(yōu)秀的生物信息學(xué)博客沐旨，歡迎廣大博客主投稿！
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PCR吊宋、RT-PCR纲辽、qRT-PCR實(shí)驗(yàn)精髓
PCR PCR是很多科研者進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室做的第一個分子實(shí)驗(yàn)，名字聽起來很高級璃搜，其實(shí)操作起來流程還是比較清晰明了拖吼，容易上手。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Rea...
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最近整理了幾類常用的繪圖代碼最近比較忙，所以有段時(shí)間沒有更新了唾糯，后面多多更新怠硼，再補(bǔ)過來! 之前整理了關(guān)于熱圖的繪圖代碼鬼贱，包括常規(guī)熱圖，和個性化加標(biāo)簽的熱圖香璃，剛好最近有小伙伴說能不能整理幾個常用的繪圖代碼...
