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DESeq2差異分析十全大補(bǔ)使用筆記寫(xiě)在前面：新手老菜鳥(niǎo)胁黑，個(gè)人心得，不足之處歡迎交流指正唇跨；寫(xiě)作不易，轉(zhuǎn)載前請(qǐng)聯(lián)系我征得同意，謝謝阵翎。 1.基本原理 1.1 概述 全稱(chēng)：DESeq2 package for dif...
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RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（四）：差異分析前的準(zhǔn)備——數(shù)據(jù)檢查本節(jié)概覽：數(shù)據(jù)預(yù)處理, 進(jìn)行樣本間具有可比性boxplot查看樣本的基因整體表達(dá)情況查看不同分組的聚類(lèi)情況：樣本hclust 圖贰军、距離熱圖、PCA圖、差異基因熱圖词疼、相關(guān)性熱圖...
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R可視化之ComplexHeatmap【二】：行（列）順序俯树、行（列）名特別聲明：本部分（系列）內(nèi)容均來(lái)自顧祖光博士對(duì)ComplexHeatmap的介紹，僅為學(xué)習(xí)交流贰盗，尊重原創(chuàng)许饿。 熱圖系列我們已經(jīng)有： R可視化之ComplexHeatmap【一】...
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手瓦糟，打工人，搬運(yùn)工赴蝇。<br>像王子文一樣財(cái)務(wù)自由菩浙，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
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富集分析GO句伶，KEGG劲蜻，DO等市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上；...
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）轉(zhuǎn)換為gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol----前不久拿到公司給的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果考余，Gene ID是以ENMUST開(kāi)頭斋竞，查了一下，ENST為EMBL 核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中人類(lèi)的轉(zhuǎn)錄本ID秃殉，ENMUST為鼠的轉(zhuǎn)錄本ID坝初。一般我...
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NGS從業(yè)6年，邊學(xué)習(xí)樱哼，邊分享~
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學(xué)生信的那些事兒之二 - （小白）怎么學(xué)生信
只有當(dāng)一個(gè)人對(duì)自己失去信心的那一刻哀九，他才是真的過(guò)時(shí)了〗练——《飛馳人生》 什么是生物信息學(xué) 生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集阅束、處理、存儲(chǔ)茄唐、傳播息裸，分...
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【康華同學(xué)】:優(yōu)秀生物信息學(xué)博客 專(zhuān)注收集優(yōu)秀的生物信息學(xué)博客呼盆，歡迎廣大博客主投稿年扩！
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PCR厨幻、RT-PCR、qRT-PCR實(shí)驗(yàn)精髓
PCR PCR是很多科研者進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室做的第一個(gè)分子實(shí)驗(yàn)腿时，名字聽(tīng)起來(lái)很高級(jí)况脆，其實(shí)操作起來(lái)流程還是比較清晰明了，容易上手圈匆。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Rea...
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最近整理了幾類(lèi)常用的繪圖代碼最近比較忙跃赚，所以有段時(shí)間沒(méi)有更新了，后面多多更新性湿，再補(bǔ)過(guò)來(lái)! 之前整理了關(guān)于熱圖的繪圖代碼纬傲，包括常規(guī)熱圖，和個(gè)性化加標(biāo)簽的熱圖肤频，剛好最近有小伙伴說(shuō)能不能整理幾個(gè)常用的繪圖代碼...
