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發(fā)簡(jiǎn)信
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TCGA臨床數(shù)據(jù)和各種組學(xué)數(shù)據(jù)自動(dòng)批量下載和處理教程 -
在win系統(tǒng)上做生信數(shù)據(jù)分析如何快速檢查和填寫(xiě)正確的文件路徑在win系統(tǒng)上做生信數(shù)據(jù)分析如何快速檢查和填寫(xiě)正確的文件路徑，避免分析報(bào)錯(cuò) 文件路徑?jīng)]有填寫(xiě)正確導(dǎo)致分析報(bào)錯(cuò)或閃退的問(wèn)題 視頻教程 https://www.bilibili....
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轉(zhuǎn)錄組和基因表達(dá)芯片的免疫浸潤(rùn)分析教程和接生信分析代做服務(wù)OmicsTools軟件介紹和下載 軟件介紹 我開(kāi)發(fā)了一款本地電腦無(wú)限使用的各領(lǐng)域綜合全能的零代碼生信數(shù)據(jù)分析作圖神器電腦軟件OmicsTools，歡迎大家使用OmicsTo...
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細(xì)胞通訊分析現(xiàn)在已經(jīng)更新了
單細(xì)胞測(cè)序問(wèn)題
用omicstools軟件辰妙，按照模版以及自己的樣本（都是兩組）都可以進(jìn)行分析，如果換成四組的樣本甫窟，提示 發(fā)生錯(cuò)誤： unable to start png() device ...
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嗯嗯密浑，好的
獲取單細(xì)胞sample_info.csv疑問(wèn)
這個(gè)數(shù)據(jù)集有單細(xì)胞和RNAseq的，20,21,22是單細(xì)胞的粗井，在根據(jù)GSE id自動(dòng)下載處理GEO數(shù)據(jù)那里下載尔破，中途報(bào)錯(cuò)只下載了這些文件（圖3），sample_info.c...
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只有C盤(pán)的windows系統(tǒng)通過(guò)磁盤(pán)分區(qū)分出D盤(pán)為什么要從C盤(pán)中分出D盤(pán)浇衬？ windows電腦的一個(gè)良好的操作規(guī)范是：C盤(pán)是系統(tǒng)盤(pán)懒构，D盤(pán)是軟件盤(pán)，E盤(pán)是數(shù)據(jù)盤(pán)耘擂，軟件一般安裝在D盤(pán)胆剧，大家的一些數(shù)據(jù)資料可以放在E盤(pán)，軟件大家一...
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細(xì)胞通訊下個(gè)月會(huì)出醉冤，但是先出擬時(shí)序分析秩霍，現(xiàn)在還在更新機(jī)器學(xué)習(xí)等模塊 查看圖片
單細(xì)胞測(cè)序問(wèn)題
用omicstools軟件，按照模版以及自己的樣本（都是兩組）都可以進(jìn)行分析蚁阳，如果換成四組的樣本铃绒，提示 發(fā)生錯(cuò)誤： unable to start png() device ...
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在描述需到的問(wèn)題的時(shí)候盡量把問(wèn)題描述清晰，提供充足的操作步驟截圖螺捐，軟件界面填寫(xiě)的參數(shù)截圖颠悬，數(shù)據(jù)文件截圖和報(bào)錯(cuò)問(wèn)題截圖等信息整理成圖文文章的形式，你描述的太籠統(tǒng)了
單細(xì)胞測(cè)序問(wèn)題
用omicstools軟件定血，按照模版以及自己的樣本（都是兩組）都可以進(jìn)行分析赔癌，如果換成四組的樣本，提示 發(fā)生錯(cuò)誤： unable to start png() device ...
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甲基化組學(xué)全流程生信分析教程甲基化組學(xué)全流程分析和可視化教程 讀取數(shù)據(jù)目錄下的idat文件的甲基化全流程一鍵分析 功能簡(jiǎn)介 甲基化分析模塊可以實(shí)現(xiàn)甲基化芯片450K, 870kEPIC數(shù)據(jù)的自動(dòng)讀取澜沟，可...
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@JSlideferriswhe 我說(shuō)的是你把細(xì)胞名字精簡(jiǎn)一下届榄，條形圖和熱圖的排版會(huì)變得更好看一些，后續(xù)我會(huì)圖 umap 和 tsne 圖的比例優(yōu)化一下
omicsTools單細(xì)胞一些圖優(yōu)化的建議
單獨(dú)繪制每個(gè)基因的feature plot倔喂，里面的unsplit_group_feature_plot拉太長(zhǎng)了铝条，一組基因的feature plot拼圖繪制那里的話就是壓的太扁...
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@JSlideferriswhe 你構(gòu)建分組信息的時(shí)候咱圆，沒(méi)有用到所有的樣本胜茧，出現(xiàn)了這個(gè)問(wèn)題
讀取單個(gè)單細(xì)胞表達(dá)矩陣文件count.txt.gz的問(wèn)題求助3
質(zhì)控這里根據(jù)大佬提示加了sample,運(yùn)行會(huì)報(bào)錯(cuò)精绎，圖3是1.seurat下的metadata文件昧穿，圖5是sample_info_sub.csv文件
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有很多圖看起來(lái)不好看奋姿，主要就是你的細(xì)胞名字太長(zhǎng)了脉课，你把細(xì)胞的名字精簡(jiǎn)一下立哑，有些有的圖我會(huì)再優(yōu)化一下
omicsTools單細(xì)胞一些圖優(yōu)化的建議
單獨(dú)繪制每個(gè)基因的feature plot品腹，里面的unsplit_group_feature_plot拉太長(zhǎng)了，一組基因的feature plot拼圖繪制那里的話就是壓的太扁...
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@JSlideferriswhe 你的這個(gè)問(wèn)題是你的原始樣本注釋信息里有22個(gè)樣本莹妒，單細(xì)胞的meta.data文件中也應(yīng)該是22個(gè)樣本名船，但是你后面構(gòu)建的分組信息里樣本編號(hào)數(shù)量沒(méi)有22個(gè)，導(dǎo)致無(wú)法跟單細(xì)胞的meda.data中的樣本編號(hào)完全匹配旨怠，給單細(xì)胞的meta.data的所有樣本都注釋出分組信息渠驼，就出現(xiàn)了錯(cuò)誤。
讀取單個(gè)單細(xì)胞表達(dá)矩陣文件count.txt.gz的問(wèn)題求助2
首先根據(jù)文章作者提供的metadata文件（圖一）鉴腻，以及作者的count.txt.gz迷扇，隨后讀取成功得到metadata.csv和single cell_raw_scRNAs...
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@JSlideferriswhe 發(fā)這一步的 rds 文件和 meta.data 文件
所有類型細(xì)胞中基因在不同分組的差異表達(dá)分析疑問(wèn)
做這一步的時(shí)候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功，但是用7.cell_anno_me...
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@JSlideferriswhe 如果你有數(shù)據(jù)集運(yùn)行成功爽哎，這個(gè)數(shù)據(jù)集遇到問(wèn)題蜓席，可能是你這個(gè)數(shù)據(jù)集有些問(wèn)題，這樣课锌，你發(fā)我30塊紅包厨内，把你的這個(gè)數(shù)據(jù)集發(fā)給我，我?guī)湍憧纯茨愕倪@個(gè)數(shù)據(jù)集
所有類型細(xì)胞中基因在不同分組的差異表達(dá)分析疑問(wèn)
做這一步的時(shí)候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功渺贤，但是用7.cell_anno_me...
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你還要看看你填的這些列名參數(shù)是不是都在你的meta.data文件中存在隘庄，且是對(duì)的
所有類型細(xì)胞中基因在不同分組的差異表達(dá)分析疑問(wèn)
做這一步的時(shí)候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功，但是用7.cell_anno_me...
個(gè)人介紹
OmicsTools 零代碼生信分析神器電腦軟件作者癣亚，全網(wǎng)賬號(hào)邢博士談科教丑掺，分享生信技能知識(shí)，提供生信個(gè)性化分析述雾，科研作圖和論文復(fù)現(xiàn)等服務(wù)街州。 TB店鋪: 生信研究 如果大家覺(jué)得我的內(nèi)容對(duì)您有用，歡迎關(guān)注一下我的賬號(hào)玻孟，謝謝