@xizzy 您好癣蟋,感謝您的回答督笆。我的研究目的是做普通轉(zhuǎn)錄組的上游分析伶棒,將人源的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)從fastq格式原始數(shù)據(jù)處理到獲得表達(dá)矩陣,應(yīng)該較為適合使用parabricks摩泪。通過(guò)文章看到您的A30顯卡顯存為24 GB,分析人源轉(zhuǎn)錄組會(huì)不會(huì)出現(xiàn)顯存不夠的情況?我計(jì)劃購(gòu)買(mǎi)4060ti 16GB版用于數(shù)據(jù)處理吱晒,可以忍受速度慢一點(diǎn),不知是否會(huì)因?yàn)轱@存不夠而根本無(wú)法進(jìn)行數(shù)據(jù)處理沦童,您有什么建議么仑濒???????
GATK太慢?利用GPU加速讓W(xué)GS/WES分析按分鐘交付目前偷遗,隨著測(cè)序成本的降低墩瞳,越來(lái)越多的WGS/WES項(xiàng)目開(kāi)始普及,也更多的課題組擁有自己的服務(wù)器氏豌,但是大數(shù)據(jù)帶來(lái)的計(jì)算緩慢問(wèn)題也越發(fā)凸顯喉酌。這里和大家分享基于英偉達(dá)GPU的 Cl...