多組學(xué)流程開發(fā)
IP屬地：黑龍江
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心动看，又辜負(fù)了努力
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要有自己的筆記尊剔，不能就這樣把PPT放上來
四、Linux之shell腳本編程
1.Linux系統(tǒng)環(huán)境 2.變量 3.結(jié)構(gòu)化語句 (1)if語句 (2)while語句 參數(shù)擴(kuò)展3.2.9 4.Shell腳本編程 任務(wù)提交
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這是舊版本的了，新版本conda安裝后不再這這樣
linux安裝或卸載miniconda
Conda 是一個開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)拯田，用于安裝多個版本的軟件包及其依賴關(guān)系历造，并在它們之間輕松切換。 1.安裝conda 瀏覽器搜索 miniconda 清華 ...
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對bed文件有些疑問船庇，對于外顯子測序吭产，真的使用這個文件嗎
8 比對及找變異步驟的質(zhì)控
使用qualimap對wes的比對bam人家總結(jié)測序深度和覆蓋度 1 比對的各個階段的bam進(jìn)行質(zhì)控 可以把中間生成的.bam文件刪除，就是帶marked的bam文件 安裝b...
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@NICE_AGIS 如果你測試OK邑蒋，那就用自己的方法
samtools的安裝和使用
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集姓蜂。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
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直接刪除這一行就好
關(guān)于外顯子坐標(biāo)文件的一個問題
今天在跑gatk call variant的時候，報了這樣的一個錯誤 報錯信息說：坐標(biāo)文件中有一個位置的終止坐標(biāo)69716217医吊，而起始坐標(biāo)是69716218钱慢，也就是說終止坐...
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要不要出個工具合集。卿堂。束莫。雖然網(wǎng)站也能用，但是學(xué)了生信就只想用R或Linux了
SNP功能注釋網(wǎng)站合集
這篇文章是對SNP位點(diǎn)功能注釋在線網(wǎng)站的一個總結(jié)帖草描。 軟件排名不分先后览绿，優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。 彩蛋在最后陶珠，請堅持看完 1挟裂、GWAS4D, 推薦指數(shù)：**** 網(wǎng)址：htt...
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關(guān)于mac電腦連接服務(wù)器掉線的解決方法
是在mac的家目錄里面.ssh添加多一個config 然后寫入這下面幾行行 然后回車诀蓉，新起一行，按一下 Ctrl C 結(jié)束暑脆，最后重新登錄服務(wù)器即可
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非常感謝你的反饋渠啤，我會仔細(xì)檢查一遍，更新后再發(fā)布
用picard制作外顯子坐標(biāo)文件
--------------- Nickier 2018-12-07 --------------- 第一次用picard添吗，不知道怎么用沥曹，先用conda安裝了一個 找到需要的...
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Linux中國是一家創(chuàng)立于2003年的國內(nèi)開源社區(qū),主要關(guān)注方向在 Linux 推廣妓美、Linux 技術(shù)研究、Linux 業(yè)界事件的傳播鲤孵。Linux 中國包括網(wǎng)站壶栋、微博、微信和郵件列表等平臺普监。
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linuc系統(tǒng)與工具
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上游分析結(jié)合數(shù)據(jù)好好理解一下戳吝，每一步都做了什么，數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義又是什么
RNA-seq實戰(zhàn)分析流程
一贯涎、下載測序數(shù)據(jù) ①SRA數(shù)據(jù)庫[存儲二代測序的原始數(shù)據(jù)]②在進(jìn)行上游分析時听哭，數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換過程概述如下：sra↓FASTQ↓bam↓counts③質(zhì)控處理的相關(guān)軟件：? fa...
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@魚嘯九天 謝謝，希望能幫到你
一文理解環(huán)境變量
一文理解環(huán)境變量 對于Linux初學(xué)者來說塘雳，環(huán)境變量是個很陌生的名詞陆盘，很多人不能理解它是到底是什么，可以用來干嘛败明。其實隘马，環(huán)境變量，在windows中也有妻顶，只是我們平時不怎么直...
