轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子，在動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育及其對(duì)外界環(huán)境的反應(yīng)中起著重要的調(diào)控作用，已成為現(xiàn)在生物學(xué)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)，其功能分析是重要的研究?jī)?nèi)容之一骗村。因此我們可以通過(guò)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
-
知識(shí)分享| 轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化分析(5)——轉(zhuǎn)錄因子及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè) -
基因家族分析一(NBS基因家族鑒定)一：準(zhǔn)備文件 1. 擬南芥的基因組蜓席，CDS吏垮，蛋白铺根，GFF以及HMM文件宪躯。 2.利用HMM文件搜尋pep文件 3.利用clustalw進(jìn)行多序列比對(duì)，構(gòu)建物種特定的NB-ARC...
-
@Nuvolar 好的好的位迂，謝謝老師
3K水稻SNP數(shù)據(jù)集的簡(jiǎn)單利用
3010份亞洲稻群體重測(cè)序項(xiàng)目是由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭眷唉，聯(lián)合國(guó)際水稻研究所、華大基因等16家單位共同完成囤官。該研究對(duì)來(lái)自89個(gè)國(guó)家的3,010份水稻品種進(jìn)行了重測(cè)序...
-
@Nuvolar 好的冬阳，謝謝老師。確實(shí)有屬于哪個(gè)國(guó)家的信息党饮，但是比如中國(guó)肝陪，中國(guó)也太大了，該怎么寫(xiě)經(jīng)緯度刑顺？??
3K水稻SNP數(shù)據(jù)集的簡(jiǎn)單利用
3010份亞洲稻群體重測(cè)序項(xiàng)目是由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭氯窍，聯(lián)合國(guó)際水稻研究所、華大基因等16家單位共同完成蹲堂。該研究對(duì)來(lái)自89個(gè)國(guó)家的3,010份水稻品種進(jìn)行了重測(cè)序...
-
老師狼讨，您好。請(qǐng)問(wèn)在哪可以下載3K材料的地理位置信息啊柒竞，真沒(méi)找到政供。
3K水稻SNP數(shù)據(jù)集的簡(jiǎn)單利用
3010份亞洲稻群體重測(cè)序項(xiàng)目是由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭，聯(lián)合國(guó)際水稻研究所朽基、華大基因等16家單位共同完成布隔。該研究對(duì)來(lái)自89個(gè)國(guó)家的3,010份水稻品種進(jìn)行了重測(cè)序...
-
拜讀了您的文章，請(qǐng)問(wèn)shortstack參數(shù)是怎么設(shè)置的稼虎？
第一篇SCI
這是一篇純生信的3.5分文章衅檀，主要涉及的是小RNA: phasiRNA。小麥的基因組前兩年才發(fā)表霎俩，而類似的研究以前在水稻中做過(guò)比較多哀军，因此對(duì)于做小麥的科研人員來(lái)說(shuō)是一個(gè)可以做...
-
請(qǐng)教一下，phasiRNA怎么鑒定打却？
small RNA學(xué)習(xí)（四）：鑒定&注釋產(chǎn)生小RNA的基因
1. 使用ShortStack鑒定杉适，注釋產(chǎn)生小RNA的基因 1.1 下載安裝 1.2 下載依賴的軟件（包） perl, samtools, bowtie & bowtie-b...
-
可不可以通過(guò)測(cè)序的reads去比對(duì)phasiRNA數(shù)據(jù)庫(kù)？
small RNA學(xué)習(xí)（四）：鑒定&注釋產(chǎn)生小RNA的基因
1. 使用ShortStack鑒定学密，注釋產(chǎn)生小RNA的基因 1.1 下載安裝 1.2 下載依賴的軟件（包） perl, samtools, bowtie & bowtie-b...
-
西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡(jiǎn)信不回答問(wèn)題腻暮，有問(wèn)題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
-
群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基因型缺失數(shù)據(jù)的填充
Genotype Imputation是在高通量測(cè)序中常出現(xiàn)的定義彤守，按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個(gè)概念哭靖，我們就需要先理解基因型缺失（genotyp...
-
學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
-
公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組铺坞、腫瘤免疫起宽、單細(xì)胞組學(xué)
-
能出一期，從vcf文件到fas序列的教程不
2020-12-21利用PopART繪制單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
A圖中就是一個(gè)單體型網(wǎng)絡(luò)济榨，每個(gè)彩色圓代表一種單體型坯沪，圓的大小表示該單體型包含的樣本數(shù)，兩個(gè)圓之間的連線表示兩個(gè)單體型彼此相關(guān)擒滑，連線上的短線表示從一個(gè)單體型變?yōu)榱硪粋€(gè)單體型需要...
-
南京櫻花大學(xué)<br>
-
-
西電 北大 SelectDB<br>Apache Doris PMC Member<br>
-
Python讀取大文件的"坑“與內(nèi)存占用檢測(cè)python讀寫(xiě)文件的api都很簡(jiǎn)單巨柒，一不留神就容易踩”坑“。筆者記錄一次踩坑歷程柠衍，并且給了一些總結(jié)潘拱，希望到大家在使用python的過(guò)程之中，能夠避免一些可能產(chǎn)生隱患的代碼拧略。...
-
連雨不知春去垫蛆，一晴方覺(jué)夏深
-
【非模式種轉(zhuǎn)錄組】二禽最、下游分析R語(yǔ)言篇這里是佳奧！我們繼續(xù)非模式種轉(zhuǎn)錄組的下游分析袱饭。 上篇我們拿到了raw count矩陣川无，但是我們還缺少很多東西，讓我們一步一步來(lái)虑乖。 1懦趋、選擇合適方法標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)矩陣 2、GO/K...
-
ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)在實(shí)踐之前疹味，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識(shí)點(diǎn)：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預(yù)測(cè)染色質(zhì)的類型（異...
